Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM4

OPTC, Opticin, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTCQ9UBM4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OPTCQ9UBM4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OPTCQ9UBM4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OPTCQ9UBM4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OPTCQ9UBM4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OPTCQ9UBM4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OPTCQ9UBM4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OPTCQ9UBM4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OPTCQ9UBM4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OPTCQ9UBM4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OPTCQ9UBM4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OPTCQ9UBM4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
OPTCQ9UBM4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OPTCQ9UBM4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OPTCQ9UBM4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
OPTCQ9UBM4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OPTCQ9UBM4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
OPTCQ9UBM4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OPTCQ9UBM4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OPTCQ9UBM4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OPTCQ9UBM4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OPTCQ9UBM4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
OPTCQ9UBM4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OPTCQ9UBM4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
OPTCQ9UBM4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OPTCQ9UBM4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OPTCQ9UBM4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OPTCQ9UBM4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OPTCQ9UBM4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OPTCQ9UBM4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OPTCQ9UBM4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OPTCQ9UBM4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
OPTCQ9UBM4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OPTCQ9UBM4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
OPTCQ9UBM4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OPTCQ9UBM4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OPTCQ9UBM4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OPTCQ9UBM4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OPTCQ9UBM4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OPTCQ9UBM4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OPTCQ9UBM4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OPTCQ9UBM4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OPTCQ9UBM4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OPTCQ9UBM4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OPTCQ9UBM4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OPTCQ9UBM4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
OPTCQ9UBM4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
OPTCQ9UBM4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24■■□□□ 1.43
OPTCQ9UBM4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OPTCQ9UBM4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OPTCQ9UBM4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
OPTCQ9UBM4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
OPTCQ9UBM4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
OPTCQ9UBM4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
OPTCQ9UBM4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OPTCQ9UBM4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OPTCQ9UBM4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
OPTCQ9UBM4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OPTCQ9UBM4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
OPTCQ9UBM4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
OPTCQ9UBM4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
OPTCQ9UBM4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OPTCQ9UBM4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OPTCQ9UBM4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OPTCQ9UBM4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
OPTCQ9UBM4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OPTCQ9UBM4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OPTCQ9UBM4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OPTCQ9UBM4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
OPTCQ9UBM4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
OPTCQ9UBM4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OPTCQ9UBM4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OPTCQ9UBM4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OPTCQ9UBM4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OPTCQ9UBM4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
OPTCQ9UBM4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OPTCQ9UBM4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OPTCQ9UBM4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OPTCQ9UBM4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OPTCQ9UBM4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OPTCQ9UBM4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OPTCQ9UBM4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OPTCQ9UBM4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OPTCQ9UBM4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
OPTCQ9UBM4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
OPTCQ9UBM4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OPTCQ9UBM4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OPTCQ9UBM4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OPTCQ9UBM4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OPTCQ9UBM4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
OPTCQ9UBM4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OPTCQ9UBM4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OPTCQ9UBM4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
OPTCQ9UBM4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OPTCQ9UBM4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OPTCQ9UBM4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OPTCQ9UBM4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OPTCQ9UBM4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OPTCQ9UBM4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OPTCQ9UBM4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms