Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPARGC1AQ9UBK2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PPARGC1AQ9UBK2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPARGC1AQ9UBK2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPARGC1AQ9UBK2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPARGC1AQ9UBK2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPARGC1AQ9UBK2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPARGC1AQ9UBK2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPARGC1AQ9UBK2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPARGC1AQ9UBK2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPARGC1AQ9UBK2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPARGC1AQ9UBK2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PPARGC1AQ9UBK2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPARGC1AQ9UBK2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPARGC1AQ9UBK2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPARGC1AQ9UBK2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPARGC1AQ9UBK2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPARGC1AQ9UBK2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPARGC1AQ9UBK2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPARGC1AQ9UBK2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPARGC1AQ9UBK2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPARGC1AQ9UBK2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPARGC1AQ9UBK2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PPARGC1AQ9UBK2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPARGC1AQ9UBK2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPARGC1AQ9UBK2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPARGC1AQ9UBK2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPARGC1AQ9UBK2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPARGC1AQ9UBK2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPARGC1AQ9UBK2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPARGC1AQ9UBK2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPARGC1AQ9UBK2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPARGC1AQ9UBK2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPARGC1AQ9UBK2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPARGC1AQ9UBK2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPARGC1AQ9UBK2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPARGC1AQ9UBK2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPARGC1AQ9UBK2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPARGC1AQ9UBK2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PPARGC1AQ9UBK2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPARGC1AQ9UBK2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPARGC1AQ9UBK2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPARGC1AQ9UBK2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPARGC1AQ9UBK2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PPARGC1AQ9UBK2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPARGC1AQ9UBK2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPARGC1AQ9UBK2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPARGC1AQ9UBK2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPARGC1AQ9UBK2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPARGC1AQ9UBK2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPARGC1AQ9UBK2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPARGC1AQ9UBK2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PPARGC1AQ9UBK2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPARGC1AQ9UBK2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PPARGC1AQ9UBK2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPARGC1AQ9UBK2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPARGC1AQ9UBK2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPARGC1AQ9UBK2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPARGC1AQ9UBK2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPARGC1AQ9UBK2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPARGC1AQ9UBK2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPARGC1AQ9UBK2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPARGC1AQ9UBK2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPARGC1AQ9UBK2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPARGC1AQ9UBK2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPARGC1AQ9UBK2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPARGC1AQ9UBK2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPARGC1AQ9UBK2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPARGC1AQ9UBK2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPARGC1AQ9UBK2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPARGC1AQ9UBK2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PPARGC1AQ9UBK2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PPARGC1AQ9UBK2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPARGC1AQ9UBK2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPARGC1AQ9UBK2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPARGC1AQ9UBK2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPARGC1AQ9UBK2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPARGC1AQ9UBK2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPARGC1AQ9UBK2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPARGC1AQ9UBK2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPARGC1AQ9UBK2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPARGC1AQ9UBK2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPARGC1AQ9UBK2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPARGC1AQ9UBK2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPARGC1AQ9UBK2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPARGC1AQ9UBK2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPARGC1AQ9UBK2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPARGC1AQ9UBK2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPARGC1AQ9UBK2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PPARGC1AQ9UBK2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPARGC1AQ9UBK2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPARGC1AQ9UBK2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPARGC1AQ9UBK2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPARGC1AQ9UBK2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPARGC1AQ9UBK2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PPARGC1AQ9UBK2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms