Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC7

GALP, Galanin-like peptide, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALPQ9UBC7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GALPQ9UBC7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GALPQ9UBC7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GALPQ9UBC7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GALPQ9UBC7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GALPQ9UBC7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GALPQ9UBC7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GALPQ9UBC7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GALPQ9UBC7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GALPQ9UBC7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GALPQ9UBC7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GALPQ9UBC7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GALPQ9UBC7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GALPQ9UBC7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GALPQ9UBC7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GALPQ9UBC7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GALPQ9UBC7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GALPQ9UBC7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GALPQ9UBC7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GALPQ9UBC7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GALPQ9UBC7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GALPQ9UBC7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GALPQ9UBC7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GALPQ9UBC7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GALPQ9UBC7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GALPQ9UBC7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GALPQ9UBC7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GALPQ9UBC7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GALPQ9UBC7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GALPQ9UBC7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GALPQ9UBC7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GALPQ9UBC7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GALPQ9UBC7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GALPQ9UBC7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GALPQ9UBC7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GALPQ9UBC7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GALPQ9UBC7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GALPQ9UBC7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GALPQ9UBC7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GALPQ9UBC7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GALPQ9UBC7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GALPQ9UBC7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GALPQ9UBC7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GALPQ9UBC7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GALPQ9UBC7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GALPQ9UBC7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GALPQ9UBC7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GALPQ9UBC7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GALPQ9UBC7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GALPQ9UBC7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GALPQ9UBC7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GALPQ9UBC7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GALPQ9UBC7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GALPQ9UBC7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GALPQ9UBC7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GALPQ9UBC7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GALPQ9UBC7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GALPQ9UBC7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GALPQ9UBC7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GALPQ9UBC7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GALPQ9UBC7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GALPQ9UBC7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GALPQ9UBC7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GALPQ9UBC7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GALPQ9UBC7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GALPQ9UBC7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GALPQ9UBC7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GALPQ9UBC7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GALPQ9UBC7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GALPQ9UBC7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GALPQ9UBC7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GALPQ9UBC7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GALPQ9UBC7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GALPQ9UBC7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GALPQ9UBC7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GALPQ9UBC7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GALPQ9UBC7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GALPQ9UBC7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GALPQ9UBC7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GALPQ9UBC7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GALPQ9UBC7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GALPQ9UBC7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GALPQ9UBC7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GALPQ9UBC7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
GALPQ9UBC7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GALPQ9UBC7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GALPQ9UBC7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GALPQ9UBC7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GALPQ9UBC7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GALPQ9UBC7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GALPQ9UBC7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GALPQ9UBC7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GALPQ9UBC7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GALPQ9UBC7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GALPQ9UBC7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GALPQ9UBC7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GALPQ9UBC7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GALPQ9UBC7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GALPQ9UBC7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GALPQ9UBC7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms