Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DNMT3BQ9UBC3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DNMT3BQ9UBC3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DNMT3BQ9UBC3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNMT3BQ9UBC3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNMT3BQ9UBC3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNMT3BQ9UBC3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNMT3BQ9UBC3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
DNMT3BQ9UBC3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNMT3BQ9UBC3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNMT3BQ9UBC3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNMT3BQ9UBC3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
DNMT3BQ9UBC3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DNMT3BQ9UBC3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNMT3BQ9UBC3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNMT3BQ9UBC3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNMT3BQ9UBC3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNMT3BQ9UBC3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNMT3BQ9UBC3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
DNMT3BQ9UBC3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNMT3BQ9UBC3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNMT3BQ9UBC3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNMT3BQ9UBC3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNMT3BQ9UBC3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNMT3BQ9UBC3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNMT3BQ9UBC3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNMT3BQ9UBC3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNMT3BQ9UBC3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNMT3BQ9UBC3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNMT3BQ9UBC3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNMT3BQ9UBC3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNMT3BQ9UBC3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DNMT3BQ9UBC3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNMT3BQ9UBC3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNMT3BQ9UBC3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNMT3BQ9UBC3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNMT3BQ9UBC3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNMT3BQ9UBC3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNMT3BQ9UBC3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNMT3BQ9UBC3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNMT3BQ9UBC3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNMT3BQ9UBC3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNMT3BQ9UBC3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNMT3BQ9UBC3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DNMT3BQ9UBC3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
DNMT3BQ9UBC3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
DNMT3BQ9UBC3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DNMT3BQ9UBC3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNMT3BQ9UBC3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNMT3BQ9UBC3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNMT3BQ9UBC3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNMT3BQ9UBC3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNMT3BQ9UBC3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNMT3BQ9UBC3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNMT3BQ9UBC3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DNMT3BQ9UBC3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DNMT3BQ9UBC3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DNMT3BQ9UBC3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DNMT3BQ9UBC3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DNMT3BQ9UBC3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DNMT3BQ9UBC3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DNMT3BQ9UBC3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DNMT3BQ9UBC3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DNMT3BQ9UBC3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DNMT3BQ9UBC3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DNMT3BQ9UBC3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DNMT3BQ9UBC3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DNMT3BQ9UBC3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DNMT3BQ9UBC3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DNMT3BQ9UBC3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DNMT3BQ9UBC3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DNMT3BQ9UBC3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DNMT3BQ9UBC3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DNMT3BQ9UBC3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
DNMT3BQ9UBC3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DNMT3BQ9UBC3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DNMT3BQ9UBC3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DNMT3BQ9UBC3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DNMT3BQ9UBC3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DNMT3BQ9UBC3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
DNMT3BQ9UBC3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DNMT3BQ9UBC3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DNMT3BQ9UBC3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DNMT3BQ9UBC3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DNMT3BQ9UBC3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNMT3BQ9UBC3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNMT3BQ9UBC3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNMT3BQ9UBC3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNMT3BQ9UBC3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNMT3BQ9UBC3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
DNMT3BQ9UBC3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNMT3BQ9UBC3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNMT3BQ9UBC3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNMT3BQ9UBC3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
DNMT3BQ9UBC3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNMT3BQ9UBC3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DNMT3BQ9UBC3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
DNMT3BQ9UBC3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DNMT3BQ9UBC3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DNMT3BQ9UBC3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms