Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNAJC28Q9NX36 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNAJC28Q9NX36 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNAJC28Q9NX36 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNAJC28Q9NX36 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNAJC28Q9NX36 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNAJC28Q9NX36 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNAJC28Q9NX36 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAJC28Q9NX36 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAJC28Q9NX36 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAJC28Q9NX36 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAJC28Q9NX36 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAJC28Q9NX36 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAJC28Q9NX36 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAJC28Q9NX36 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAJC28Q9NX36 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAJC28Q9NX36 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNAJC28Q9NX36 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNAJC28Q9NX36 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNAJC28Q9NX36 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNAJC28Q9NX36 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNAJC28Q9NX36 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNAJC28Q9NX36 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNAJC28Q9NX36 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNAJC28Q9NX36 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNAJC28Q9NX36 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNAJC28Q9NX36 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNAJC28Q9NX36 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNAJC28Q9NX36 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNAJC28Q9NX36 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNAJC28Q9NX36 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNAJC28Q9NX36 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNAJC28Q9NX36 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DNAJC28Q9NX36 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNAJC28Q9NX36 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNAJC28Q9NX36 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNAJC28Q9NX36 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DNAJC28Q9NX36 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNAJC28Q9NX36 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNAJC28Q9NX36 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNAJC28Q9NX36 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNAJC28Q9NX36 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNAJC28Q9NX36 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNAJC28Q9NX36 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNAJC28Q9NX36 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNAJC28Q9NX36 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNAJC28Q9NX36 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNAJC28Q9NX36 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNAJC28Q9NX36 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNAJC28Q9NX36 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
DNAJC28Q9NX36 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNAJC28Q9NX36 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNAJC28Q9NX36 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNAJC28Q9NX36 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNAJC28Q9NX36 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNAJC28Q9NX36 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNAJC28Q9NX36 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNAJC28Q9NX36 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNAJC28Q9NX36 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNAJC28Q9NX36 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNAJC28Q9NX36 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNAJC28Q9NX36 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNAJC28Q9NX36 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNAJC28Q9NX36 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNAJC28Q9NX36 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNAJC28Q9NX36 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNAJC28Q9NX36 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNAJC28Q9NX36 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
DNAJC28Q9NX36 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNAJC28Q9NX36 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
DNAJC28Q9NX36 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNAJC28Q9NX36 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNAJC28Q9NX36 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNAJC28Q9NX36 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNAJC28Q9NX36 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNAJC28Q9NX36 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNAJC28Q9NX36 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNAJC28Q9NX36 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNAJC28Q9NX36 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNAJC28Q9NX36 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNAJC28Q9NX36 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DNAJC28Q9NX36 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DNAJC28Q9NX36 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DNAJC28Q9NX36 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DNAJC28Q9NX36 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DNAJC28Q9NX36 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNAJC28Q9NX36 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNAJC28Q9NX36 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
DNAJC28Q9NX36 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNAJC28Q9NX36 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNAJC28Q9NX36 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNAJC28Q9NX36 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNAJC28Q9NX36 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DNAJC28Q9NX36 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNAJC28Q9NX36 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNAJC28Q9NX36 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNAJC28Q9NX36 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNAJC28Q9NX36 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNAJC28Q9NX36 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNAJC28Q9NX36 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms