Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVW2

RLIM, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLIMQ9NVW2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RLIMQ9NVW2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RLIMQ9NVW2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RLIMQ9NVW2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RLIMQ9NVW2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RLIMQ9NVW2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RLIMQ9NVW2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RLIMQ9NVW2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RLIMQ9NVW2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RLIMQ9NVW2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RLIMQ9NVW2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RLIMQ9NVW2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RLIMQ9NVW2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RLIMQ9NVW2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RLIMQ9NVW2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RLIMQ9NVW2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RLIMQ9NVW2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RLIMQ9NVW2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RLIMQ9NVW2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RLIMQ9NVW2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RLIMQ9NVW2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RLIMQ9NVW2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RLIMQ9NVW2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RLIMQ9NVW2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RLIMQ9NVW2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RLIMQ9NVW2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RLIMQ9NVW2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RLIMQ9NVW2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RLIMQ9NVW2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RLIMQ9NVW2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RLIMQ9NVW2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RLIMQ9NVW2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RLIMQ9NVW2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RLIMQ9NVW2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RLIMQ9NVW2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RLIMQ9NVW2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RLIMQ9NVW2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RLIMQ9NVW2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RLIMQ9NVW2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RLIMQ9NVW2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RLIMQ9NVW2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RLIMQ9NVW2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RLIMQ9NVW2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RLIMQ9NVW2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RLIMQ9NVW2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RLIMQ9NVW2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RLIMQ9NVW2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RLIMQ9NVW2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RLIMQ9NVW2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RLIMQ9NVW2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RLIMQ9NVW2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RLIMQ9NVW2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RLIMQ9NVW2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RLIMQ9NVW2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RLIMQ9NVW2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RLIMQ9NVW2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RLIMQ9NVW2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RLIMQ9NVW2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RLIMQ9NVW2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RLIMQ9NVW2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RLIMQ9NVW2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RLIMQ9NVW2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RLIMQ9NVW2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RLIMQ9NVW2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RLIMQ9NVW2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RLIMQ9NVW2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RLIMQ9NVW2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RLIMQ9NVW2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RLIMQ9NVW2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RLIMQ9NVW2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RLIMQ9NVW2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RLIMQ9NVW2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RLIMQ9NVW2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RLIMQ9NVW2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RLIMQ9NVW2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RLIMQ9NVW2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RLIMQ9NVW2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RLIMQ9NVW2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RLIMQ9NVW2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RLIMQ9NVW2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RLIMQ9NVW2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RLIMQ9NVW2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RLIMQ9NVW2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RLIMQ9NVW2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RLIMQ9NVW2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RLIMQ9NVW2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RLIMQ9NVW2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RLIMQ9NVW2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RLIMQ9NVW2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RLIMQ9NVW2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RLIMQ9NVW2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RLIMQ9NVW2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RLIMQ9NVW2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RLIMQ9NVW2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RLIMQ9NVW2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RLIMQ9NVW2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RLIMQ9NVW2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RLIMQ9NVW2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RLIMQ9NVW2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RLIMQ9NVW2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms