Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV06

DCAF13, DDB1- and CUL4-associated factor 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF13Q9NV06 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCAF13Q9NV06 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCAF13Q9NV06 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DCAF13Q9NV06 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCAF13Q9NV06 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCAF13Q9NV06 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCAF13Q9NV06 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCAF13Q9NV06 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCAF13Q9NV06 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCAF13Q9NV06 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DCAF13Q9NV06 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCAF13Q9NV06 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCAF13Q9NV06 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCAF13Q9NV06 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCAF13Q9NV06 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DCAF13Q9NV06 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCAF13Q9NV06 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCAF13Q9NV06 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCAF13Q9NV06 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCAF13Q9NV06 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCAF13Q9NV06 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCAF13Q9NV06 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCAF13Q9NV06 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCAF13Q9NV06 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DCAF13Q9NV06 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCAF13Q9NV06 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCAF13Q9NV06 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCAF13Q9NV06 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCAF13Q9NV06 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCAF13Q9NV06 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCAF13Q9NV06 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCAF13Q9NV06 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DCAF13Q9NV06 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCAF13Q9NV06 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCAF13Q9NV06 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DCAF13Q9NV06 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCAF13Q9NV06 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCAF13Q9NV06 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DCAF13Q9NV06 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCAF13Q9NV06 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCAF13Q9NV06 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCAF13Q9NV06 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCAF13Q9NV06 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCAF13Q9NV06 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCAF13Q9NV06 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCAF13Q9NV06 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCAF13Q9NV06 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCAF13Q9NV06 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCAF13Q9NV06 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCAF13Q9NV06 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCAF13Q9NV06 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCAF13Q9NV06 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCAF13Q9NV06 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCAF13Q9NV06 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCAF13Q9NV06 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCAF13Q9NV06 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCAF13Q9NV06 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCAF13Q9NV06 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCAF13Q9NV06 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCAF13Q9NV06 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCAF13Q9NV06 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCAF13Q9NV06 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCAF13Q9NV06 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCAF13Q9NV06 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCAF13Q9NV06 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCAF13Q9NV06 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCAF13Q9NV06 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCAF13Q9NV06 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCAF13Q9NV06 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCAF13Q9NV06 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCAF13Q9NV06 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCAF13Q9NV06 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCAF13Q9NV06 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCAF13Q9NV06 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCAF13Q9NV06 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCAF13Q9NV06 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCAF13Q9NV06 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCAF13Q9NV06 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCAF13Q9NV06 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DCAF13Q9NV06 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCAF13Q9NV06 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCAF13Q9NV06 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCAF13Q9NV06 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCAF13Q9NV06 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCAF13Q9NV06 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCAF13Q9NV06 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCAF13Q9NV06 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DCAF13Q9NV06 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCAF13Q9NV06 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DCAF13Q9NV06 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCAF13Q9NV06 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCAF13Q9NV06 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCAF13Q9NV06 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCAF13Q9NV06 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCAF13Q9NV06 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCAF13Q9NV06 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCAF13Q9NV06 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCAF13Q9NV06 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCAF13Q9NV06 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCAF13Q9NV06 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms