Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN7

ACER3, Alkaline ceramidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3Q9NUN7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACER3Q9NUN7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACER3Q9NUN7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACER3Q9NUN7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACER3Q9NUN7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACER3Q9NUN7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACER3Q9NUN7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACER3Q9NUN7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACER3Q9NUN7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACER3Q9NUN7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACER3Q9NUN7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACER3Q9NUN7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACER3Q9NUN7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACER3Q9NUN7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACER3Q9NUN7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACER3Q9NUN7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACER3Q9NUN7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACER3Q9NUN7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACER3Q9NUN7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACER3Q9NUN7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACER3Q9NUN7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACER3Q9NUN7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACER3Q9NUN7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACER3Q9NUN7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACER3Q9NUN7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACER3Q9NUN7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACER3Q9NUN7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACER3Q9NUN7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACER3Q9NUN7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACER3Q9NUN7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ACER3Q9NUN7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACER3Q9NUN7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACER3Q9NUN7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACER3Q9NUN7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACER3Q9NUN7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACER3Q9NUN7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACER3Q9NUN7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACER3Q9NUN7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACER3Q9NUN7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACER3Q9NUN7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACER3Q9NUN7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACER3Q9NUN7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACER3Q9NUN7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACER3Q9NUN7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACER3Q9NUN7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACER3Q9NUN7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ACER3Q9NUN7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACER3Q9NUN7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACER3Q9NUN7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACER3Q9NUN7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACER3Q9NUN7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACER3Q9NUN7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ACER3Q9NUN7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACER3Q9NUN7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ACER3Q9NUN7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACER3Q9NUN7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACER3Q9NUN7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACER3Q9NUN7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACER3Q9NUN7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACER3Q9NUN7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACER3Q9NUN7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACER3Q9NUN7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ACER3Q9NUN7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACER3Q9NUN7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACER3Q9NUN7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACER3Q9NUN7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACER3Q9NUN7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACER3Q9NUN7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACER3Q9NUN7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ACER3Q9NUN7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACER3Q9NUN7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACER3Q9NUN7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACER3Q9NUN7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACER3Q9NUN7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACER3Q9NUN7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACER3Q9NUN7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACER3Q9NUN7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACER3Q9NUN7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACER3Q9NUN7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACER3Q9NUN7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACER3Q9NUN7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACER3Q9NUN7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ACER3Q9NUN7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ACER3Q9NUN7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ACER3Q9NUN7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACER3Q9NUN7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ACER3Q9NUN7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACER3Q9NUN7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACER3Q9NUN7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACER3Q9NUN7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACER3Q9NUN7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACER3Q9NUN7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACER3Q9NUN7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACER3Q9NUN7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACER3Q9NUN7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACER3Q9NUN7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACER3Q9NUN7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACER3Q9NUN7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACER3Q9NUN7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACER3Q9NUN7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms