Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUE0

ZDHHC18, Palmitoyltransferase ZDHHC18, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC18Q9NUE0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZDHHC18Q9NUE0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZDHHC18Q9NUE0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZDHHC18Q9NUE0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZDHHC18Q9NUE0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZDHHC18Q9NUE0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZDHHC18Q9NUE0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZDHHC18Q9NUE0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZDHHC18Q9NUE0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZDHHC18Q9NUE0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZDHHC18Q9NUE0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ZDHHC18Q9NUE0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ZDHHC18Q9NUE0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZDHHC18Q9NUE0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZDHHC18Q9NUE0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZDHHC18Q9NUE0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZDHHC18Q9NUE0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZDHHC18Q9NUE0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZDHHC18Q9NUE0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZDHHC18Q9NUE0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZDHHC18Q9NUE0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZDHHC18Q9NUE0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZDHHC18Q9NUE0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZDHHC18Q9NUE0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZDHHC18Q9NUE0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZDHHC18Q9NUE0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ZDHHC18Q9NUE0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZDHHC18Q9NUE0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ZDHHC18Q9NUE0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZDHHC18Q9NUE0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZDHHC18Q9NUE0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZDHHC18Q9NUE0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ZDHHC18Q9NUE0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZDHHC18Q9NUE0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZDHHC18Q9NUE0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZDHHC18Q9NUE0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZDHHC18Q9NUE0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZDHHC18Q9NUE0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZDHHC18Q9NUE0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZDHHC18Q9NUE0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZDHHC18Q9NUE0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZDHHC18Q9NUE0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZDHHC18Q9NUE0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZDHHC18Q9NUE0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZDHHC18Q9NUE0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZDHHC18Q9NUE0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZDHHC18Q9NUE0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZDHHC18Q9NUE0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ZDHHC18Q9NUE0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZDHHC18Q9NUE0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZDHHC18Q9NUE0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZDHHC18Q9NUE0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZDHHC18Q9NUE0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZDHHC18Q9NUE0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZDHHC18Q9NUE0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZDHHC18Q9NUE0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZDHHC18Q9NUE0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZDHHC18Q9NUE0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZDHHC18Q9NUE0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZDHHC18Q9NUE0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZDHHC18Q9NUE0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZDHHC18Q9NUE0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZDHHC18Q9NUE0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZDHHC18Q9NUE0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZDHHC18Q9NUE0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
ZDHHC18Q9NUE0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZDHHC18Q9NUE0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZDHHC18Q9NUE0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZDHHC18Q9NUE0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZDHHC18Q9NUE0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZDHHC18Q9NUE0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZDHHC18Q9NUE0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZDHHC18Q9NUE0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZDHHC18Q9NUE0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZDHHC18Q9NUE0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZDHHC18Q9NUE0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZDHHC18Q9NUE0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZDHHC18Q9NUE0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZDHHC18Q9NUE0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZDHHC18Q9NUE0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZDHHC18Q9NUE0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZDHHC18Q9NUE0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZDHHC18Q9NUE0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZDHHC18Q9NUE0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZDHHC18Q9NUE0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZDHHC18Q9NUE0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZDHHC18Q9NUE0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZDHHC18Q9NUE0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZDHHC18Q9NUE0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZDHHC18Q9NUE0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZDHHC18Q9NUE0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZDHHC18Q9NUE0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZDHHC18Q9NUE0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZDHHC18Q9NUE0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZDHHC18Q9NUE0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZDHHC18Q9NUE0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZDHHC18Q9NUE0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZDHHC18Q9NUE0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZDHHC18Q9NUE0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZDHHC18Q9NUE0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms