Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM7SF3Q9NS93 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM7SF3Q9NS93 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TM7SF3Q9NS93 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TM7SF3Q9NS93 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM7SF3Q9NS93 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TM7SF3Q9NS93 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM7SF3Q9NS93 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM7SF3Q9NS93 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM7SF3Q9NS93 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM7SF3Q9NS93 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM7SF3Q9NS93 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM7SF3Q9NS93 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM7SF3Q9NS93 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM7SF3Q9NS93 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM7SF3Q9NS93 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM7SF3Q9NS93 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TM7SF3Q9NS93 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TM7SF3Q9NS93 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TM7SF3Q9NS93 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TM7SF3Q9NS93 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TM7SF3Q9NS93 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TM7SF3Q9NS93 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TM7SF3Q9NS93 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TM7SF3Q9NS93 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM7SF3Q9NS93 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TM7SF3Q9NS93 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TM7SF3Q9NS93 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TM7SF3Q9NS93 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TM7SF3Q9NS93 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TM7SF3Q9NS93 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TM7SF3Q9NS93 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TM7SF3Q9NS93 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TM7SF3Q9NS93 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TM7SF3Q9NS93 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TM7SF3Q9NS93 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TM7SF3Q9NS93 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TM7SF3Q9NS93 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TM7SF3Q9NS93 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM7SF3Q9NS93 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM7SF3Q9NS93 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM7SF3Q9NS93 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM7SF3Q9NS93 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM7SF3Q9NS93 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM7SF3Q9NS93 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM7SF3Q9NS93 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TM7SF3Q9NS93 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TM7SF3Q9NS93 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM7SF3Q9NS93 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM7SF3Q9NS93 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM7SF3Q9NS93 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM7SF3Q9NS93 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM7SF3Q9NS93 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TM7SF3Q9NS93 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TM7SF3Q9NS93 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TM7SF3Q9NS93 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TM7SF3Q9NS93 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TM7SF3Q9NS93 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TM7SF3Q9NS93 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TM7SF3Q9NS93 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM7SF3Q9NS93 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM7SF3Q9NS93 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM7SF3Q9NS93 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM7SF3Q9NS93 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM7SF3Q9NS93 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM7SF3Q9NS93 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM7SF3Q9NS93 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TM7SF3Q9NS93 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TM7SF3Q9NS93 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TM7SF3Q9NS93 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TM7SF3Q9NS93 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TM7SF3Q9NS93 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TM7SF3Q9NS93 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TM7SF3Q9NS93 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM7SF3Q9NS93 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM7SF3Q9NS93 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM7SF3Q9NS93 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM7SF3Q9NS93 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM7SF3Q9NS93 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM7SF3Q9NS93 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM7SF3Q9NS93 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM7SF3Q9NS93 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM7SF3Q9NS93 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TM7SF3Q9NS93 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM7SF3Q9NS93 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM7SF3Q9NS93 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM7SF3Q9NS93 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM7SF3Q9NS93 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM7SF3Q9NS93 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM7SF3Q9NS93 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TM7SF3Q9NS93 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM7SF3Q9NS93 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM7SF3Q9NS93 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM7SF3Q9NS93 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM7SF3Q9NS93 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM7SF3Q9NS93 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TM7SF3Q9NS93 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TM7SF3Q9NS93 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TM7SF3Q9NS93 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM7SF3Q9NS93 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms