Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
TULP4Q9NRJ4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
TULP4Q9NRJ4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
TULP4Q9NRJ4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
TULP4Q9NRJ4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
TULP4Q9NRJ4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TULP4Q9NRJ4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TULP4Q9NRJ4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
TULP4Q9NRJ4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TULP4Q9NRJ4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TULP4Q9NRJ4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
TULP4Q9NRJ4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TULP4Q9NRJ4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
TULP4Q9NRJ4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TULP4Q9NRJ4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TULP4Q9NRJ4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
TULP4Q9NRJ4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
TULP4Q9NRJ4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
TULP4Q9NRJ4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
TULP4Q9NRJ4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TULP4Q9NRJ4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
TULP4Q9NRJ4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
TULP4Q9NRJ4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TULP4Q9NRJ4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TULP4Q9NRJ4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC34.72■■■■□ 3.15
TULP4Q9NRJ4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
TULP4Q9NRJ4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TULP4Q9NRJ4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TULP4Q9NRJ4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
TULP4Q9NRJ4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC34.7■■■■□ 3.14
TULP4Q9NRJ4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
TULP4Q9NRJ4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
TULP4Q9NRJ4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
TULP4Q9NRJ4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
TULP4Q9NRJ4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TULP4Q9NRJ4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
TULP4Q9NRJ4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
TULP4Q9NRJ4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
TULP4Q9NRJ4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
TULP4Q9NRJ4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
TULP4Q9NRJ4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TULP4Q9NRJ4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TULP4Q9NRJ4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
TULP4Q9NRJ4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TULP4Q9NRJ4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TULP4Q9NRJ4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TULP4Q9NRJ4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TULP4Q9NRJ4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
TULP4Q9NRJ4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
TULP4Q9NRJ4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC34.65■■■■□ 3.14
TULP4Q9NRJ4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
TULP4Q9NRJ4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
TULP4Q9NRJ4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
TULP4Q9NRJ4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
TULP4Q9NRJ4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
TULP4Q9NRJ4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
TULP4Q9NRJ4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TULP4Q9NRJ4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TULP4Q9NRJ4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TULP4Q9NRJ4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TULP4Q9NRJ4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TULP4Q9NRJ4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TULP4Q9NRJ4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TULP4Q9NRJ4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TULP4Q9NRJ4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TULP4Q9NRJ4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TULP4Q9NRJ4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TULP4Q9NRJ4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TULP4Q9NRJ4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TULP4Q9NRJ4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TULP4Q9NRJ4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TULP4Q9NRJ4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TULP4Q9NRJ4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TULP4Q9NRJ4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TULP4Q9NRJ4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
TULP4Q9NRJ4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
TULP4Q9NRJ4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TULP4Q9NRJ4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TULP4Q9NRJ4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC34.57■■■■□ 3.13
TULP4Q9NRJ4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
TULP4Q9NRJ4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
TULP4Q9NRJ4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
TULP4Q9NRJ4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
TULP4Q9NRJ4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
TULP4Q9NRJ4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
TULP4Q9NRJ4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
TULP4Q9NRJ4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TULP4Q9NRJ4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TULP4Q9NRJ4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TULP4Q9NRJ4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TULP4Q9NRJ4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
TULP4Q9NRJ4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
TULP4Q9NRJ4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
TULP4Q9NRJ4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC34.52■■■■□ 3.12
TULP4Q9NRJ4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
TULP4Q9NRJ4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
TULP4Q9NRJ4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
TULP4Q9NRJ4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
TULP4Q9NRJ4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
TULP4Q9NRJ4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms