Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA1

PDGFC, Platelet-derived growth factor C, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFCQ9NRA1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDGFCQ9NRA1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDGFCQ9NRA1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDGFCQ9NRA1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDGFCQ9NRA1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PDGFCQ9NRA1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDGFCQ9NRA1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDGFCQ9NRA1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PDGFCQ9NRA1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDGFCQ9NRA1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDGFCQ9NRA1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDGFCQ9NRA1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDGFCQ9NRA1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDGFCQ9NRA1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDGFCQ9NRA1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDGFCQ9NRA1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDGFCQ9NRA1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDGFCQ9NRA1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDGFCQ9NRA1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDGFCQ9NRA1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDGFCQ9NRA1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDGFCQ9NRA1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDGFCQ9NRA1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDGFCQ9NRA1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDGFCQ9NRA1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDGFCQ9NRA1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDGFCQ9NRA1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDGFCQ9NRA1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDGFCQ9NRA1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDGFCQ9NRA1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDGFCQ9NRA1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDGFCQ9NRA1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDGFCQ9NRA1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
PDGFCQ9NRA1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
PDGFCQ9NRA1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDGFCQ9NRA1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDGFCQ9NRA1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDGFCQ9NRA1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDGFCQ9NRA1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDGFCQ9NRA1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDGFCQ9NRA1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDGFCQ9NRA1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PDGFCQ9NRA1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDGFCQ9NRA1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDGFCQ9NRA1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PDGFCQ9NRA1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
PDGFCQ9NRA1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDGFCQ9NRA1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDGFCQ9NRA1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDGFCQ9NRA1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDGFCQ9NRA1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDGFCQ9NRA1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDGFCQ9NRA1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDGFCQ9NRA1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PDGFCQ9NRA1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDGFCQ9NRA1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDGFCQ9NRA1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDGFCQ9NRA1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDGFCQ9NRA1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDGFCQ9NRA1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDGFCQ9NRA1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDGFCQ9NRA1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDGFCQ9NRA1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PDGFCQ9NRA1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PDGFCQ9NRA1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PDGFCQ9NRA1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDGFCQ9NRA1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDGFCQ9NRA1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDGFCQ9NRA1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDGFCQ9NRA1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PDGFCQ9NRA1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDGFCQ9NRA1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDGFCQ9NRA1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDGFCQ9NRA1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDGFCQ9NRA1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDGFCQ9NRA1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDGFCQ9NRA1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDGFCQ9NRA1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDGFCQ9NRA1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDGFCQ9NRA1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDGFCQ9NRA1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDGFCQ9NRA1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PDGFCQ9NRA1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDGFCQ9NRA1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDGFCQ9NRA1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDGFCQ9NRA1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDGFCQ9NRA1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDGFCQ9NRA1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
PDGFCQ9NRA1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDGFCQ9NRA1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PDGFCQ9NRA1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDGFCQ9NRA1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDGFCQ9NRA1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PDGFCQ9NRA1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDGFCQ9NRA1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDGFCQ9NRA1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDGFCQ9NRA1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDGFCQ9NRA1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDGFCQ9NRA1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDGFCQ9NRA1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms