Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C8orf4Q9NR00 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C8orf4Q9NR00 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C8orf4Q9NR00 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C8orf4Q9NR00 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C8orf4Q9NR00 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C8orf4Q9NR00 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C8orf4Q9NR00 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C8orf4Q9NR00 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C8orf4Q9NR00 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
C8orf4Q9NR00 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C8orf4Q9NR00 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C8orf4Q9NR00 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C8orf4Q9NR00 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C8orf4Q9NR00 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C8orf4Q9NR00 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C8orf4Q9NR00 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C8orf4Q9NR00 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C8orf4Q9NR00 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C8orf4Q9NR00 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C8orf4Q9NR00 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C8orf4Q9NR00 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C8orf4Q9NR00 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C8orf4Q9NR00 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C8orf4Q9NR00 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
C8orf4Q9NR00 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C8orf4Q9NR00 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C8orf4Q9NR00 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C8orf4Q9NR00 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C8orf4Q9NR00 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C8orf4Q9NR00 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C8orf4Q9NR00 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
C8orf4Q9NR00 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C8orf4Q9NR00 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C8orf4Q9NR00 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C8orf4Q9NR00 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C8orf4Q9NR00 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C8orf4Q9NR00 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C8orf4Q9NR00 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C8orf4Q9NR00 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C8orf4Q9NR00 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C8orf4Q9NR00 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C8orf4Q9NR00 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C8orf4Q9NR00 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C8orf4Q9NR00 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C8orf4Q9NR00 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C8orf4Q9NR00 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C8orf4Q9NR00 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C8orf4Q9NR00 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C8orf4Q9NR00 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C8orf4Q9NR00 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C8orf4Q9NR00 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C8orf4Q9NR00 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C8orf4Q9NR00 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C8orf4Q9NR00 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C8orf4Q9NR00 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C8orf4Q9NR00 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C8orf4Q9NR00 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C8orf4Q9NR00 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C8orf4Q9NR00 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C8orf4Q9NR00 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C8orf4Q9NR00 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C8orf4Q9NR00 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C8orf4Q9NR00 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C8orf4Q9NR00 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C8orf4Q9NR00 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C8orf4Q9NR00 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C8orf4Q9NR00 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C8orf4Q9NR00 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C8orf4Q9NR00 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C8orf4Q9NR00 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C8orf4Q9NR00 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C8orf4Q9NR00 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C8orf4Q9NR00 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C8orf4Q9NR00 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C8orf4Q9NR00 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C8orf4Q9NR00 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C8orf4Q9NR00 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C8orf4Q9NR00 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C8orf4Q9NR00 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C8orf4Q9NR00 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C8orf4Q9NR00 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C8orf4Q9NR00 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C8orf4Q9NR00 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C8orf4Q9NR00 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C8orf4Q9NR00 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C8orf4Q9NR00 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C8orf4Q9NR00 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C8orf4Q9NR00 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C8orf4Q9NR00 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C8orf4Q9NR00 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C8orf4Q9NR00 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C8orf4Q9NR00 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8orf4Q9NR00 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8orf4Q9NR00 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8orf4Q9NR00 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C8orf4Q9NR00 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C8orf4Q9NR00 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C8orf4Q9NR00 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C8orf4Q9NR00 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms