Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FZD3Q9NPG1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FZD3Q9NPG1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FZD3Q9NPG1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FZD3Q9NPG1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FZD3Q9NPG1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FZD3Q9NPG1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FZD3Q9NPG1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FZD3Q9NPG1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FZD3Q9NPG1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FZD3Q9NPG1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FZD3Q9NPG1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FZD3Q9NPG1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FZD3Q9NPG1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FZD3Q9NPG1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FZD3Q9NPG1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FZD3Q9NPG1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FZD3Q9NPG1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FZD3Q9NPG1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FZD3Q9NPG1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FZD3Q9NPG1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FZD3Q9NPG1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FZD3Q9NPG1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FZD3Q9NPG1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FZD3Q9NPG1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FZD3Q9NPG1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FZD3Q9NPG1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FZD3Q9NPG1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FZD3Q9NPG1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FZD3Q9NPG1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FZD3Q9NPG1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FZD3Q9NPG1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FZD3Q9NPG1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FZD3Q9NPG1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FZD3Q9NPG1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FZD3Q9NPG1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FZD3Q9NPG1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FZD3Q9NPG1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FZD3Q9NPG1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FZD3Q9NPG1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FZD3Q9NPG1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FZD3Q9NPG1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FZD3Q9NPG1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FZD3Q9NPG1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FZD3Q9NPG1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FZD3Q9NPG1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FZD3Q9NPG1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FZD3Q9NPG1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FZD3Q9NPG1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FZD3Q9NPG1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FZD3Q9NPG1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FZD3Q9NPG1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FZD3Q9NPG1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FZD3Q9NPG1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FZD3Q9NPG1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FZD3Q9NPG1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FZD3Q9NPG1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FZD3Q9NPG1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FZD3Q9NPG1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FZD3Q9NPG1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FZD3Q9NPG1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FZD3Q9NPG1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FZD3Q9NPG1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FZD3Q9NPG1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FZD3Q9NPG1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FZD3Q9NPG1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FZD3Q9NPG1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FZD3Q9NPG1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FZD3Q9NPG1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FZD3Q9NPG1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FZD3Q9NPG1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FZD3Q9NPG1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FZD3Q9NPG1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FZD3Q9NPG1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FZD3Q9NPG1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FZD3Q9NPG1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FZD3Q9NPG1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FZD3Q9NPG1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FZD3Q9NPG1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FZD3Q9NPG1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FZD3Q9NPG1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FZD3Q9NPG1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FZD3Q9NPG1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FZD3Q9NPG1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FZD3Q9NPG1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FZD3Q9NPG1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FZD3Q9NPG1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FZD3Q9NPG1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FZD3Q9NPG1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FZD3Q9NPG1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FZD3Q9NPG1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FZD3Q9NPG1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FZD3Q9NPG1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FZD3Q9NPG1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FZD3Q9NPG1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FZD3Q9NPG1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FZD3Q9NPG1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FZD3Q9NPG1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FZD3Q9NPG1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FZD3Q9NPG1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms