Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPF2

CHST11, Carbohydrate sulfotransferase 11, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST11Q9NPF2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHST11Q9NPF2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHST11Q9NPF2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHST11Q9NPF2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CHST11Q9NPF2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHST11Q9NPF2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHST11Q9NPF2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHST11Q9NPF2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHST11Q9NPF2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHST11Q9NPF2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHST11Q9NPF2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHST11Q9NPF2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHST11Q9NPF2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHST11Q9NPF2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CHST11Q9NPF2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHST11Q9NPF2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHST11Q9NPF2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CHST11Q9NPF2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHST11Q9NPF2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHST11Q9NPF2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHST11Q9NPF2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHST11Q9NPF2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHST11Q9NPF2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHST11Q9NPF2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHST11Q9NPF2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHST11Q9NPF2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHST11Q9NPF2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHST11Q9NPF2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHST11Q9NPF2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHST11Q9NPF2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHST11Q9NPF2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHST11Q9NPF2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHST11Q9NPF2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHST11Q9NPF2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHST11Q9NPF2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHST11Q9NPF2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHST11Q9NPF2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHST11Q9NPF2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHST11Q9NPF2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHST11Q9NPF2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CHST11Q9NPF2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHST11Q9NPF2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHST11Q9NPF2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHST11Q9NPF2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHST11Q9NPF2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHST11Q9NPF2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHST11Q9NPF2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHST11Q9NPF2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHST11Q9NPF2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHST11Q9NPF2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHST11Q9NPF2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHST11Q9NPF2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHST11Q9NPF2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHST11Q9NPF2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHST11Q9NPF2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHST11Q9NPF2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHST11Q9NPF2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHST11Q9NPF2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHST11Q9NPF2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHST11Q9NPF2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHST11Q9NPF2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHST11Q9NPF2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHST11Q9NPF2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHST11Q9NPF2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHST11Q9NPF2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHST11Q9NPF2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHST11Q9NPF2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHST11Q9NPF2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHST11Q9NPF2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHST11Q9NPF2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHST11Q9NPF2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHST11Q9NPF2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CHST11Q9NPF2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CHST11Q9NPF2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CHST11Q9NPF2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHST11Q9NPF2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHST11Q9NPF2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHST11Q9NPF2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHST11Q9NPF2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHST11Q9NPF2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHST11Q9NPF2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHST11Q9NPF2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHST11Q9NPF2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHST11Q9NPF2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHST11Q9NPF2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHST11Q9NPF2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHST11Q9NPF2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHST11Q9NPF2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHST11Q9NPF2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHST11Q9NPF2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHST11Q9NPF2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHST11Q9NPF2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHST11Q9NPF2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHST11Q9NPF2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHST11Q9NPF2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHST11Q9NPF2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHST11Q9NPF2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHST11Q9NPF2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHST11Q9NPF2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHST11Q9NPF2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.6 ms