Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC97

GPR35, G-protein coupled receptor 35, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR35Q9HC97 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPR35Q9HC97 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPR35Q9HC97 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPR35Q9HC97 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPR35Q9HC97 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPR35Q9HC97 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPR35Q9HC97 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPR35Q9HC97 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPR35Q9HC97 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPR35Q9HC97 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPR35Q9HC97 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPR35Q9HC97 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPR35Q9HC97 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPR35Q9HC97 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPR35Q9HC97 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPR35Q9HC97 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPR35Q9HC97 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPR35Q9HC97 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPR35Q9HC97 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPR35Q9HC97 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPR35Q9HC97 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPR35Q9HC97 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPR35Q9HC97 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPR35Q9HC97 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPR35Q9HC97 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPR35Q9HC97 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPR35Q9HC97 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPR35Q9HC97 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPR35Q9HC97 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPR35Q9HC97 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPR35Q9HC97 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPR35Q9HC97 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GPR35Q9HC97 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPR35Q9HC97 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GPR35Q9HC97 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPR35Q9HC97 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPR35Q9HC97 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPR35Q9HC97 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPR35Q9HC97 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPR35Q9HC97 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPR35Q9HC97 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GPR35Q9HC97 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPR35Q9HC97 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPR35Q9HC97 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPR35Q9HC97 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPR35Q9HC97 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPR35Q9HC97 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPR35Q9HC97 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPR35Q9HC97 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPR35Q9HC97 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPR35Q9HC97 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPR35Q9HC97 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPR35Q9HC97 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPR35Q9HC97 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPR35Q9HC97 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPR35Q9HC97 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPR35Q9HC97 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPR35Q9HC97 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPR35Q9HC97 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPR35Q9HC97 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPR35Q9HC97 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPR35Q9HC97 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPR35Q9HC97 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPR35Q9HC97 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPR35Q9HC97 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GPR35Q9HC97 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPR35Q9HC97 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPR35Q9HC97 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPR35Q9HC97 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPR35Q9HC97 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GPR35Q9HC97 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPR35Q9HC97 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPR35Q9HC97 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPR35Q9HC97 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPR35Q9HC97 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GPR35Q9HC97 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPR35Q9HC97 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPR35Q9HC97 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPR35Q9HC97 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPR35Q9HC97 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPR35Q9HC97 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPR35Q9HC97 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPR35Q9HC97 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPR35Q9HC97 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPR35Q9HC97 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GPR35Q9HC97 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPR35Q9HC97 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GPR35Q9HC97 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPR35Q9HC97 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPR35Q9HC97 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPR35Q9HC97 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPR35Q9HC97 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GPR35Q9HC97 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPR35Q9HC97 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPR35Q9HC97 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GPR35Q9HC97 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPR35Q9HC97 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPR35Q9HC97 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPR35Q9HC97 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPR35Q9HC97 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms