Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAK2

EBF2, Transcription factor COE2, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF2Q9HAK2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EBF2Q9HAK2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EBF2Q9HAK2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EBF2Q9HAK2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
EBF2Q9HAK2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EBF2Q9HAK2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EBF2Q9HAK2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EBF2Q9HAK2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EBF2Q9HAK2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EBF2Q9HAK2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
EBF2Q9HAK2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EBF2Q9HAK2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EBF2Q9HAK2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EBF2Q9HAK2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EBF2Q9HAK2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EBF2Q9HAK2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EBF2Q9HAK2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EBF2Q9HAK2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EBF2Q9HAK2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EBF2Q9HAK2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EBF2Q9HAK2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EBF2Q9HAK2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EBF2Q9HAK2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EBF2Q9HAK2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EBF2Q9HAK2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EBF2Q9HAK2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EBF2Q9HAK2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EBF2Q9HAK2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EBF2Q9HAK2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EBF2Q9HAK2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EBF2Q9HAK2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EBF2Q9HAK2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EBF2Q9HAK2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EBF2Q9HAK2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
EBF2Q9HAK2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EBF2Q9HAK2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EBF2Q9HAK2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EBF2Q9HAK2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EBF2Q9HAK2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EBF2Q9HAK2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EBF2Q9HAK2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EBF2Q9HAK2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
EBF2Q9HAK2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EBF2Q9HAK2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EBF2Q9HAK2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EBF2Q9HAK2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EBF2Q9HAK2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EBF2Q9HAK2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EBF2Q9HAK2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EBF2Q9HAK2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EBF2Q9HAK2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EBF2Q9HAK2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
EBF2Q9HAK2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EBF2Q9HAK2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EBF2Q9HAK2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EBF2Q9HAK2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EBF2Q9HAK2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EBF2Q9HAK2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EBF2Q9HAK2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EBF2Q9HAK2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EBF2Q9HAK2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EBF2Q9HAK2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EBF2Q9HAK2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EBF2Q9HAK2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
EBF2Q9HAK2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EBF2Q9HAK2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EBF2Q9HAK2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EBF2Q9HAK2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EBF2Q9HAK2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EBF2Q9HAK2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EBF2Q9HAK2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EBF2Q9HAK2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EBF2Q9HAK2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EBF2Q9HAK2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EBF2Q9HAK2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
EBF2Q9HAK2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EBF2Q9HAK2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EBF2Q9HAK2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EBF2Q9HAK2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
EBF2Q9HAK2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EBF2Q9HAK2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EBF2Q9HAK2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EBF2Q9HAK2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EBF2Q9HAK2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EBF2Q9HAK2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EBF2Q9HAK2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EBF2Q9HAK2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EBF2Q9HAK2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EBF2Q9HAK2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EBF2Q9HAK2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EBF2Q9HAK2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EBF2Q9HAK2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EBF2Q9HAK2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EBF2Q9HAK2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EBF2Q9HAK2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EBF2Q9HAK2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
EBF2Q9HAK2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EBF2Q9HAK2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EBF2Q9HAK2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EBF2Q9HAK2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms