Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9S0

NANOG, Homeobox protein NANOG, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGQ9H9S0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NANOGQ9H9S0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NANOGQ9H9S0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NANOGQ9H9S0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NANOGQ9H9S0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NANOGQ9H9S0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NANOGQ9H9S0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NANOGQ9H9S0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NANOGQ9H9S0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NANOGQ9H9S0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NANOGQ9H9S0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NANOGQ9H9S0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NANOGQ9H9S0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NANOGQ9H9S0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NANOGQ9H9S0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NANOGQ9H9S0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NANOGQ9H9S0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NANOGQ9H9S0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NANOGQ9H9S0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NANOGQ9H9S0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NANOGQ9H9S0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NANOGQ9H9S0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NANOGQ9H9S0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NANOGQ9H9S0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NANOGQ9H9S0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NANOGQ9H9S0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NANOGQ9H9S0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NANOGQ9H9S0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NANOGQ9H9S0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NANOGQ9H9S0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NANOGQ9H9S0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NANOGQ9H9S0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NANOGQ9H9S0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NANOGQ9H9S0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NANOGQ9H9S0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NANOGQ9H9S0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NANOGQ9H9S0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NANOGQ9H9S0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NANOGQ9H9S0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NANOGQ9H9S0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NANOGQ9H9S0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NANOGQ9H9S0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NANOGQ9H9S0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NANOGQ9H9S0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NANOGQ9H9S0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NANOGQ9H9S0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NANOGQ9H9S0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NANOGQ9H9S0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NANOGQ9H9S0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NANOGQ9H9S0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NANOGQ9H9S0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NANOGQ9H9S0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NANOGQ9H9S0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NANOGQ9H9S0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NANOGQ9H9S0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NANOGQ9H9S0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NANOGQ9H9S0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NANOGQ9H9S0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NANOGQ9H9S0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NANOGQ9H9S0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NANOGQ9H9S0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NANOGQ9H9S0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NANOGQ9H9S0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NANOGQ9H9S0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NANOGQ9H9S0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NANOGQ9H9S0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NANOGQ9H9S0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NANOGQ9H9S0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NANOGQ9H9S0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NANOGQ9H9S0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NANOGQ9H9S0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NANOGQ9H9S0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NANOGQ9H9S0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NANOGQ9H9S0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NANOGQ9H9S0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NANOGQ9H9S0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NANOGQ9H9S0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NANOGQ9H9S0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NANOGQ9H9S0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NANOGQ9H9S0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NANOGQ9H9S0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NANOGQ9H9S0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NANOGQ9H9S0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NANOGQ9H9S0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NANOGQ9H9S0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NANOGQ9H9S0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NANOGQ9H9S0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NANOGQ9H9S0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NANOGQ9H9S0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NANOGQ9H9S0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NANOGQ9H9S0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NANOGQ9H9S0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NANOGQ9H9S0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NANOGQ9H9S0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NANOGQ9H9S0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NANOGQ9H9S0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NANOGQ9H9S0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NANOGQ9H9S0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NANOGQ9H9S0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NANOGQ9H9S0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms