Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Q4

NHEJ1, Non-homologous end-joining factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHEJ1Q9H9Q4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
NHEJ1Q9H9Q4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NHEJ1Q9H9Q4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NHEJ1Q9H9Q4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NHEJ1Q9H9Q4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NHEJ1Q9H9Q4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NHEJ1Q9H9Q4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NHEJ1Q9H9Q4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NHEJ1Q9H9Q4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NHEJ1Q9H9Q4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NHEJ1Q9H9Q4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NHEJ1Q9H9Q4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NHEJ1Q9H9Q4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NHEJ1Q9H9Q4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NHEJ1Q9H9Q4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NHEJ1Q9H9Q4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NHEJ1Q9H9Q4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NHEJ1Q9H9Q4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NHEJ1Q9H9Q4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NHEJ1Q9H9Q4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NHEJ1Q9H9Q4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NHEJ1Q9H9Q4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NHEJ1Q9H9Q4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NHEJ1Q9H9Q4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NHEJ1Q9H9Q4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
NHEJ1Q9H9Q4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NHEJ1Q9H9Q4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NHEJ1Q9H9Q4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NHEJ1Q9H9Q4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NHEJ1Q9H9Q4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NHEJ1Q9H9Q4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NHEJ1Q9H9Q4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NHEJ1Q9H9Q4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NHEJ1Q9H9Q4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NHEJ1Q9H9Q4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NHEJ1Q9H9Q4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NHEJ1Q9H9Q4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NHEJ1Q9H9Q4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NHEJ1Q9H9Q4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NHEJ1Q9H9Q4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NHEJ1Q9H9Q4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NHEJ1Q9H9Q4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NHEJ1Q9H9Q4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NHEJ1Q9H9Q4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NHEJ1Q9H9Q4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NHEJ1Q9H9Q4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NHEJ1Q9H9Q4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NHEJ1Q9H9Q4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NHEJ1Q9H9Q4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NHEJ1Q9H9Q4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NHEJ1Q9H9Q4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NHEJ1Q9H9Q4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NHEJ1Q9H9Q4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NHEJ1Q9H9Q4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NHEJ1Q9H9Q4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NHEJ1Q9H9Q4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NHEJ1Q9H9Q4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NHEJ1Q9H9Q4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NHEJ1Q9H9Q4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NHEJ1Q9H9Q4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NHEJ1Q9H9Q4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NHEJ1Q9H9Q4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NHEJ1Q9H9Q4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NHEJ1Q9H9Q4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NHEJ1Q9H9Q4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NHEJ1Q9H9Q4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NHEJ1Q9H9Q4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NHEJ1Q9H9Q4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NHEJ1Q9H9Q4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NHEJ1Q9H9Q4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NHEJ1Q9H9Q4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NHEJ1Q9H9Q4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NHEJ1Q9H9Q4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NHEJ1Q9H9Q4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NHEJ1Q9H9Q4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NHEJ1Q9H9Q4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NHEJ1Q9H9Q4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NHEJ1Q9H9Q4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NHEJ1Q9H9Q4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NHEJ1Q9H9Q4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NHEJ1Q9H9Q4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NHEJ1Q9H9Q4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NHEJ1Q9H9Q4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NHEJ1Q9H9Q4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NHEJ1Q9H9Q4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NHEJ1Q9H9Q4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NHEJ1Q9H9Q4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NHEJ1Q9H9Q4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NHEJ1Q9H9Q4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NHEJ1Q9H9Q4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NHEJ1Q9H9Q4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NHEJ1Q9H9Q4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NHEJ1Q9H9Q4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NHEJ1Q9H9Q4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NHEJ1Q9H9Q4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NHEJ1Q9H9Q4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NHEJ1Q9H9Q4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NHEJ1Q9H9Q4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NHEJ1Q9H9Q4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NHEJ1Q9H9Q4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms