Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PRKRIP1Q9H875 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC33.82■■■■□ 3
PRKRIP1Q9H875 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PRKRIP1Q9H875 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PRKRIP1Q9H875 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC33.81■■■■□ 3
PRKRIP1Q9H875 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PRKRIP1Q9H875 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PRKRIP1Q9H875 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC33.8■■■■□ 3
PRKRIP1Q9H875 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PRKRIP1Q9H875 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PRKRIP1Q9H875 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PRKRIP1Q9H875 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
PRKRIP1Q9H875 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
PRKRIP1Q9H875 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PRKRIP1Q9H875 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC33.79■■■■□ 3
PRKRIP1Q9H875 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
PRKRIP1Q9H875 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
PRKRIP1Q9H875 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PRKRIP1Q9H875 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
PRKRIP1Q9H875 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PRKRIP1Q9H875 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PRKRIP1Q9H875 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PRKRIP1Q9H875 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PRKRIP1Q9H875 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PRKRIP1Q9H875 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PRKRIP1Q9H875 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PRKRIP1Q9H875 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PRKRIP1Q9H875 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PRKRIP1Q9H875 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PRKRIP1Q9H875 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PRKRIP1Q9H875 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PRKRIP1Q9H875 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PRKRIP1Q9H875 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PRKRIP1Q9H875 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PRKRIP1Q9H875 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PRKRIP1Q9H875 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PRKRIP1Q9H875 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
PRKRIP1Q9H875 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
PRKRIP1Q9H875 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PRKRIP1Q9H875 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PRKRIP1Q9H875 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PRKRIP1Q9H875 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PRKRIP1Q9H875 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PRKRIP1Q9H875 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PRKRIP1Q9H875 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PRKRIP1Q9H875 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PRKRIP1Q9H875 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PRKRIP1Q9H875 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PRKRIP1Q9H875 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PRKRIP1Q9H875 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PRKRIP1Q9H875 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PRKRIP1Q9H875 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PRKRIP1Q9H875 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PRKRIP1Q9H875 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PRKRIP1Q9H875 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PRKRIP1Q9H875 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PRKRIP1Q9H875 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PRKRIP1Q9H875 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PRKRIP1Q9H875 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PRKRIP1Q9H875 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PRKRIP1Q9H875 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PRKRIP1Q9H875 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PRKRIP1Q9H875 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PRKRIP1Q9H875 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PRKRIP1Q9H875 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PRKRIP1Q9H875 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
PRKRIP1Q9H875 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PRKRIP1Q9H875 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PRKRIP1Q9H875 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PRKRIP1Q9H875 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PRKRIP1Q9H875 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PRKRIP1Q9H875 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
PRKRIP1Q9H875 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PRKRIP1Q9H875 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PRKRIP1Q9H875 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PRKRIP1Q9H875 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PRKRIP1Q9H875 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PRKRIP1Q9H875 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PRKRIP1Q9H875 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PRKRIP1Q9H875 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PRKRIP1Q9H875 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PRKRIP1Q9H875 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PRKRIP1Q9H875 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PRKRIP1Q9H875 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PRKRIP1Q9H875 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PRKRIP1Q9H875 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PRKRIP1Q9H875 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
PRKRIP1Q9H875 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PRKRIP1Q9H875 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PRKRIP1Q9H875 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PRKRIP1Q9H875 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
PRKRIP1Q9H875 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PRKRIP1Q9H875 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PRKRIP1Q9H875 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PRKRIP1Q9H875 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PRKRIP1Q9H875 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PRKRIP1Q9H875 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PRKRIP1Q9H875 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PRKRIP1Q9H875 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PRKRIP1Q9H875 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms