Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNCQ9H7C4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNCQ9H7C4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNCQ9H7C4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNCQ9H7C4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNCQ9H7C4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNCQ9H7C4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNCQ9H7C4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNCQ9H7C4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNCQ9H7C4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNCQ9H7C4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNCQ9H7C4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNCQ9H7C4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNCQ9H7C4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNCQ9H7C4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNCQ9H7C4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNCQ9H7C4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNCQ9H7C4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNCQ9H7C4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNCQ9H7C4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYNCQ9H7C4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNCQ9H7C4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNCQ9H7C4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNCQ9H7C4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNCQ9H7C4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNCQ9H7C4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNCQ9H7C4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNCQ9H7C4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNCQ9H7C4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNCQ9H7C4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNCQ9H7C4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNCQ9H7C4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNCQ9H7C4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNCQ9H7C4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNCQ9H7C4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNCQ9H7C4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNCQ9H7C4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNCQ9H7C4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNCQ9H7C4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNCQ9H7C4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNCQ9H7C4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNCQ9H7C4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNCQ9H7C4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNCQ9H7C4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNCQ9H7C4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNCQ9H7C4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNCQ9H7C4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNCQ9H7C4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNCQ9H7C4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNCQ9H7C4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNCQ9H7C4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNCQ9H7C4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNCQ9H7C4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNCQ9H7C4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNCQ9H7C4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNCQ9H7C4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNCQ9H7C4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNCQ9H7C4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNCQ9H7C4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNCQ9H7C4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYNCQ9H7C4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYNCQ9H7C4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYNCQ9H7C4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNCQ9H7C4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNCQ9H7C4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNCQ9H7C4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYNCQ9H7C4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYNCQ9H7C4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYNCQ9H7C4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNCQ9H7C4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNCQ9H7C4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNCQ9H7C4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNCQ9H7C4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNCQ9H7C4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNCQ9H7C4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNCQ9H7C4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNCQ9H7C4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNCQ9H7C4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNCQ9H7C4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNCQ9H7C4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNCQ9H7C4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNCQ9H7C4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNCQ9H7C4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNCQ9H7C4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNCQ9H7C4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNCQ9H7C4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNCQ9H7C4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNCQ9H7C4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNCQ9H7C4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNCQ9H7C4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNCQ9H7C4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNCQ9H7C4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNCQ9H7C4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNCQ9H7C4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNCQ9H7C4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNCQ9H7C4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNCQ9H7C4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNCQ9H7C4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNCQ9H7C4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNCQ9H7C4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms