Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4W6

EBF3, Transcription factor COE3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF3Q9H4W6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EBF3Q9H4W6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
EBF3Q9H4W6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EBF3Q9H4W6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EBF3Q9H4W6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EBF3Q9H4W6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
EBF3Q9H4W6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EBF3Q9H4W6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EBF3Q9H4W6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EBF3Q9H4W6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EBF3Q9H4W6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EBF3Q9H4W6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
EBF3Q9H4W6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EBF3Q9H4W6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EBF3Q9H4W6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EBF3Q9H4W6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EBF3Q9H4W6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EBF3Q9H4W6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EBF3Q9H4W6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EBF3Q9H4W6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EBF3Q9H4W6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EBF3Q9H4W6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EBF3Q9H4W6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EBF3Q9H4W6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EBF3Q9H4W6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EBF3Q9H4W6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EBF3Q9H4W6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EBF3Q9H4W6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EBF3Q9H4W6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EBF3Q9H4W6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EBF3Q9H4W6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EBF3Q9H4W6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EBF3Q9H4W6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EBF3Q9H4W6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EBF3Q9H4W6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
EBF3Q9H4W6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EBF3Q9H4W6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
EBF3Q9H4W6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EBF3Q9H4W6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EBF3Q9H4W6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EBF3Q9H4W6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EBF3Q9H4W6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
EBF3Q9H4W6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EBF3Q9H4W6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EBF3Q9H4W6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EBF3Q9H4W6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EBF3Q9H4W6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EBF3Q9H4W6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
EBF3Q9H4W6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
EBF3Q9H4W6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EBF3Q9H4W6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EBF3Q9H4W6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EBF3Q9H4W6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EBF3Q9H4W6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EBF3Q9H4W6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EBF3Q9H4W6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EBF3Q9H4W6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EBF3Q9H4W6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EBF3Q9H4W6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EBF3Q9H4W6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EBF3Q9H4W6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EBF3Q9H4W6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EBF3Q9H4W6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EBF3Q9H4W6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EBF3Q9H4W6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EBF3Q9H4W6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
EBF3Q9H4W6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EBF3Q9H4W6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EBF3Q9H4W6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EBF3Q9H4W6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EBF3Q9H4W6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EBF3Q9H4W6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EBF3Q9H4W6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EBF3Q9H4W6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EBF3Q9H4W6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EBF3Q9H4W6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EBF3Q9H4W6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
EBF3Q9H4W6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EBF3Q9H4W6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EBF3Q9H4W6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EBF3Q9H4W6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EBF3Q9H4W6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EBF3Q9H4W6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EBF3Q9H4W6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EBF3Q9H4W6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EBF3Q9H4W6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EBF3Q9H4W6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EBF3Q9H4W6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EBF3Q9H4W6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EBF3Q9H4W6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EBF3Q9H4W6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EBF3Q9H4W6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EBF3Q9H4W6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EBF3Q9H4W6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EBF3Q9H4W6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EBF3Q9H4W6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EBF3Q9H4W6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EBF3Q9H4W6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
EBF3Q9H4W6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EBF3Q9H4W6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms