Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1M0

NUP62CL, Nucleoporin-62 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62CLQ9H1M0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NUP62CLQ9H1M0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUP62CLQ9H1M0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUP62CLQ9H1M0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUP62CLQ9H1M0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUP62CLQ9H1M0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUP62CLQ9H1M0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUP62CLQ9H1M0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP62CLQ9H1M0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP62CLQ9H1M0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP62CLQ9H1M0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP62CLQ9H1M0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP62CLQ9H1M0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP62CLQ9H1M0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP62CLQ9H1M0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP62CLQ9H1M0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP62CLQ9H1M0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP62CLQ9H1M0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUP62CLQ9H1M0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUP62CLQ9H1M0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NUP62CLQ9H1M0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUP62CLQ9H1M0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NUP62CLQ9H1M0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NUP62CLQ9H1M0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NUP62CLQ9H1M0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NUP62CLQ9H1M0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP62CLQ9H1M0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP62CLQ9H1M0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP62CLQ9H1M0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP62CLQ9H1M0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP62CLQ9H1M0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP62CLQ9H1M0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP62CLQ9H1M0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP62CLQ9H1M0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP62CLQ9H1M0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP62CLQ9H1M0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP62CLQ9H1M0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP62CLQ9H1M0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP62CLQ9H1M0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP62CLQ9H1M0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP62CLQ9H1M0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP62CLQ9H1M0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUP62CLQ9H1M0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUP62CLQ9H1M0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUP62CLQ9H1M0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUP62CLQ9H1M0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUP62CLQ9H1M0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUP62CLQ9H1M0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUP62CLQ9H1M0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUP62CLQ9H1M0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUP62CLQ9H1M0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NUP62CLQ9H1M0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NUP62CLQ9H1M0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NUP62CLQ9H1M0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NUP62CLQ9H1M0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NUP62CLQ9H1M0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP62CLQ9H1M0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP62CLQ9H1M0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP62CLQ9H1M0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP62CLQ9H1M0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP62CLQ9H1M0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP62CLQ9H1M0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP62CLQ9H1M0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP62CLQ9H1M0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP62CLQ9H1M0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP62CLQ9H1M0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP62CLQ9H1M0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP62CLQ9H1M0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUP62CLQ9H1M0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUP62CLQ9H1M0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUP62CLQ9H1M0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUP62CLQ9H1M0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUP62CLQ9H1M0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUP62CLQ9H1M0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUP62CLQ9H1M0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUP62CLQ9H1M0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUP62CLQ9H1M0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUP62CLQ9H1M0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP62CLQ9H1M0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP62CLQ9H1M0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP62CLQ9H1M0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP62CLQ9H1M0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP62CLQ9H1M0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP62CLQ9H1M0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP62CLQ9H1M0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP62CLQ9H1M0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP62CLQ9H1M0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP62CLQ9H1M0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NUP62CLQ9H1M0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NUP62CLQ9H1M0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NUP62CLQ9H1M0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NUP62CLQ9H1M0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NUP62CLQ9H1M0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NUP62CLQ9H1M0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NUP62CLQ9H1M0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NUP62CLQ9H1M0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUP62CLQ9H1M0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUP62CLQ9H1M0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUP62CLQ9H1M0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUP62CLQ9H1M0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms