Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Z9

RBM38, RNA-binding protein 38, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM38Q9H0Z9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBM38Q9H0Z9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBM38Q9H0Z9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBM38Q9H0Z9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBM38Q9H0Z9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBM38Q9H0Z9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBM38Q9H0Z9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RBM38Q9H0Z9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM38Q9H0Z9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM38Q9H0Z9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM38Q9H0Z9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM38Q9H0Z9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM38Q9H0Z9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM38Q9H0Z9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM38Q9H0Z9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM38Q9H0Z9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM38Q9H0Z9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM38Q9H0Z9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM38Q9H0Z9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBM38Q9H0Z9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBM38Q9H0Z9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBM38Q9H0Z9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBM38Q9H0Z9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBM38Q9H0Z9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBM38Q9H0Z9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBM38Q9H0Z9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBM38Q9H0Z9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM38Q9H0Z9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM38Q9H0Z9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM38Q9H0Z9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM38Q9H0Z9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM38Q9H0Z9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM38Q9H0Z9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBM38Q9H0Z9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBM38Q9H0Z9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBM38Q9H0Z9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RBM38Q9H0Z9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RBM38Q9H0Z9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBM38Q9H0Z9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBM38Q9H0Z9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBM38Q9H0Z9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBM38Q9H0Z9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBM38Q9H0Z9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM38Q9H0Z9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM38Q9H0Z9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM38Q9H0Z9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM38Q9H0Z9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM38Q9H0Z9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM38Q9H0Z9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM38Q9H0Z9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM38Q9H0Z9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM38Q9H0Z9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM38Q9H0Z9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM38Q9H0Z9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM38Q9H0Z9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM38Q9H0Z9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM38Q9H0Z9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM38Q9H0Z9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM38Q9H0Z9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM38Q9H0Z9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM38Q9H0Z9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM38Q9H0Z9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM38Q9H0Z9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM38Q9H0Z9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM38Q9H0Z9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM38Q9H0Z9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM38Q9H0Z9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM38Q9H0Z9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM38Q9H0Z9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBM38Q9H0Z9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBM38Q9H0Z9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBM38Q9H0Z9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBM38Q9H0Z9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBM38Q9H0Z9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM38Q9H0Z9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM38Q9H0Z9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM38Q9H0Z9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM38Q9H0Z9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM38Q9H0Z9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM38Q9H0Z9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM38Q9H0Z9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM38Q9H0Z9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM38Q9H0Z9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM38Q9H0Z9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM38Q9H0Z9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM38Q9H0Z9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM38Q9H0Z9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM38Q9H0Z9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM38Q9H0Z9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM38Q9H0Z9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM38Q9H0Z9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM38Q9H0Z9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM38Q9H0Z9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM38Q9H0Z9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM38Q9H0Z9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM38Q9H0Z9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM38Q9H0Z9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM38Q9H0Z9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBM38Q9H0Z9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBM38Q9H0Z9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
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