Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J1

B3GNT4, N-acetyllactosaminide beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3GNT4Q9C0J1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
B3GNT4Q9C0J1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
B3GNT4Q9C0J1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
B3GNT4Q9C0J1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
B3GNT4Q9C0J1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
B3GNT4Q9C0J1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
B3GNT4Q9C0J1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
B3GNT4Q9C0J1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
B3GNT4Q9C0J1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
B3GNT4Q9C0J1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
B3GNT4Q9C0J1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
B3GNT4Q9C0J1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
B3GNT4Q9C0J1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
B3GNT4Q9C0J1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
B3GNT4Q9C0J1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
B3GNT4Q9C0J1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
B3GNT4Q9C0J1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
B3GNT4Q9C0J1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
B3GNT4Q9C0J1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
B3GNT4Q9C0J1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
B3GNT4Q9C0J1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
B3GNT4Q9C0J1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
B3GNT4Q9C0J1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
B3GNT4Q9C0J1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
B3GNT4Q9C0J1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
B3GNT4Q9C0J1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
B3GNT4Q9C0J1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
B3GNT4Q9C0J1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
B3GNT4Q9C0J1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
B3GNT4Q9C0J1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
B3GNT4Q9C0J1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
B3GNT4Q9C0J1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
B3GNT4Q9C0J1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
B3GNT4Q9C0J1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
B3GNT4Q9C0J1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
B3GNT4Q9C0J1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
B3GNT4Q9C0J1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
B3GNT4Q9C0J1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
B3GNT4Q9C0J1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
B3GNT4Q9C0J1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
B3GNT4Q9C0J1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
B3GNT4Q9C0J1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
B3GNT4Q9C0J1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
B3GNT4Q9C0J1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
B3GNT4Q9C0J1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
B3GNT4Q9C0J1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
B3GNT4Q9C0J1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
B3GNT4Q9C0J1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
B3GNT4Q9C0J1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
B3GNT4Q9C0J1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
B3GNT4Q9C0J1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
B3GNT4Q9C0J1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
B3GNT4Q9C0J1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
B3GNT4Q9C0J1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
B3GNT4Q9C0J1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
B3GNT4Q9C0J1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
B3GNT4Q9C0J1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
B3GNT4Q9C0J1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
B3GNT4Q9C0J1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
B3GNT4Q9C0J1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
B3GNT4Q9C0J1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
B3GNT4Q9C0J1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
B3GNT4Q9C0J1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
B3GNT4Q9C0J1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
B3GNT4Q9C0J1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
B3GNT4Q9C0J1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
B3GNT4Q9C0J1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
B3GNT4Q9C0J1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
B3GNT4Q9C0J1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
B3GNT4Q9C0J1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
B3GNT4Q9C0J1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
B3GNT4Q9C0J1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
B3GNT4Q9C0J1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
B3GNT4Q9C0J1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
B3GNT4Q9C0J1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
B3GNT4Q9C0J1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
B3GNT4Q9C0J1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
B3GNT4Q9C0J1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
B3GNT4Q9C0J1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
B3GNT4Q9C0J1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
B3GNT4Q9C0J1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
B3GNT4Q9C0J1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
B3GNT4Q9C0J1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
B3GNT4Q9C0J1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
B3GNT4Q9C0J1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
B3GNT4Q9C0J1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
B3GNT4Q9C0J1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
B3GNT4Q9C0J1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
B3GNT4Q9C0J1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
B3GNT4Q9C0J1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
B3GNT4Q9C0J1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
B3GNT4Q9C0J1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
B3GNT4Q9C0J1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
B3GNT4Q9C0J1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
B3GNT4Q9C0J1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
B3GNT4Q9C0J1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
B3GNT4Q9C0J1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
B3GNT4Q9C0J1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
B3GNT4Q9C0J1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
B3GNT4Q9C0J1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms