Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM4Q9C037 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM4Q9C037 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM4Q9C037 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM4Q9C037 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM4Q9C037 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM4Q9C037 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM4Q9C037 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM4Q9C037 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM4Q9C037 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM4Q9C037 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM4Q9C037 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM4Q9C037 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM4Q9C037 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM4Q9C037 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM4Q9C037 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM4Q9C037 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM4Q9C037 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM4Q9C037 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM4Q9C037 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM4Q9C037 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM4Q9C037 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM4Q9C037 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM4Q9C037 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM4Q9C037 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM4Q9C037 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM4Q9C037 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM4Q9C037 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM4Q9C037 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM4Q9C037 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM4Q9C037 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM4Q9C037 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM4Q9C037 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM4Q9C037 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM4Q9C037 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM4Q9C037 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIM4Q9C037 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM4Q9C037 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM4Q9C037 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM4Q9C037 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM4Q9C037 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM4Q9C037 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM4Q9C037 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM4Q9C037 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM4Q9C037 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM4Q9C037 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM4Q9C037 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM4Q9C037 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM4Q9C037 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM4Q9C037 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM4Q9C037 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM4Q9C037 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM4Q9C037 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM4Q9C037 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM4Q9C037 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM4Q9C037 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM4Q9C037 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM4Q9C037 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM4Q9C037 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM4Q9C037 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM4Q9C037 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM4Q9C037 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM4Q9C037 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM4Q9C037 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM4Q9C037 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM4Q9C037 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM4Q9C037 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM4Q9C037 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM4Q9C037 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM4Q9C037 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM4Q9C037 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM4Q9C037 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM4Q9C037 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM4Q9C037 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM4Q9C037 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM4Q9C037 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM4Q9C037 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM4Q9C037 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM4Q9C037 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM4Q9C037 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM4Q9C037 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM4Q9C037 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM4Q9C037 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM4Q9C037 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM4Q9C037 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM4Q9C037 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM4Q9C037 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM4Q9C037 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM4Q9C037 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM4Q9C037 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM4Q9C037 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM4Q9C037 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM4Q9C037 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM4Q9C037 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM4Q9C037 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM4Q9C037 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM4Q9C037 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM4Q9C037 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM4Q9C037 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM4Q9C037 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms