Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYU1

PBX4, Pre-B-cell leukemia transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX4Q9BYU1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PBX4Q9BYU1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PBX4Q9BYU1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PBX4Q9BYU1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PBX4Q9BYU1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PBX4Q9BYU1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PBX4Q9BYU1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PBX4Q9BYU1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PBX4Q9BYU1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PBX4Q9BYU1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PBX4Q9BYU1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PBX4Q9BYU1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PBX4Q9BYU1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PBX4Q9BYU1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PBX4Q9BYU1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PBX4Q9BYU1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PBX4Q9BYU1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PBX4Q9BYU1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PBX4Q9BYU1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PBX4Q9BYU1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PBX4Q9BYU1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PBX4Q9BYU1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PBX4Q9BYU1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PBX4Q9BYU1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PBX4Q9BYU1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PBX4Q9BYU1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PBX4Q9BYU1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PBX4Q9BYU1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PBX4Q9BYU1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PBX4Q9BYU1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PBX4Q9BYU1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PBX4Q9BYU1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PBX4Q9BYU1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PBX4Q9BYU1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PBX4Q9BYU1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PBX4Q9BYU1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PBX4Q9BYU1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PBX4Q9BYU1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PBX4Q9BYU1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PBX4Q9BYU1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PBX4Q9BYU1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PBX4Q9BYU1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PBX4Q9BYU1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PBX4Q9BYU1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PBX4Q9BYU1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PBX4Q9BYU1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PBX4Q9BYU1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PBX4Q9BYU1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PBX4Q9BYU1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PBX4Q9BYU1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PBX4Q9BYU1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PBX4Q9BYU1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PBX4Q9BYU1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PBX4Q9BYU1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PBX4Q9BYU1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PBX4Q9BYU1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PBX4Q9BYU1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PBX4Q9BYU1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PBX4Q9BYU1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PBX4Q9BYU1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PBX4Q9BYU1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PBX4Q9BYU1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PBX4Q9BYU1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PBX4Q9BYU1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PBX4Q9BYU1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PBX4Q9BYU1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PBX4Q9BYU1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PBX4Q9BYU1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PBX4Q9BYU1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PBX4Q9BYU1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PBX4Q9BYU1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PBX4Q9BYU1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PBX4Q9BYU1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PBX4Q9BYU1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PBX4Q9BYU1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PBX4Q9BYU1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PBX4Q9BYU1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PBX4Q9BYU1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PBX4Q9BYU1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PBX4Q9BYU1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PBX4Q9BYU1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PBX4Q9BYU1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PBX4Q9BYU1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PBX4Q9BYU1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PBX4Q9BYU1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PBX4Q9BYU1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PBX4Q9BYU1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PBX4Q9BYU1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PBX4Q9BYU1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PBX4Q9BYU1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PBX4Q9BYU1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PBX4Q9BYU1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PBX4Q9BYU1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PBX4Q9BYU1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PBX4Q9BYU1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PBX4Q9BYU1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PBX4Q9BYU1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PBX4Q9BYU1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PBX4Q9BYU1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PBX4Q9BYU1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms