Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABARAPL3Q9BY60 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABARAPL3Q9BY60 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABARAPL3Q9BY60 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABARAPL3Q9BY60 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABARAPL3Q9BY60 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABARAPL3Q9BY60 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABARAPL3Q9BY60 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABARAPL3Q9BY60 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABARAPL3Q9BY60 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABARAPL3Q9BY60 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABARAPL3Q9BY60 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABARAPL3Q9BY60 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABARAPL3Q9BY60 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABARAPL3Q9BY60 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABARAPL3Q9BY60 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABARAPL3Q9BY60 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABARAPL3Q9BY60 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABARAPL3Q9BY60 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABARAPL3Q9BY60 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
GABARAPL3Q9BY60 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABARAPL3Q9BY60 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABARAPL3Q9BY60 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABARAPL3Q9BY60 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABARAPL3Q9BY60 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GABARAPL3Q9BY60 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GABARAPL3Q9BY60 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABARAPL3Q9BY60 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABARAPL3Q9BY60 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABARAPL3Q9BY60 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABARAPL3Q9BY60 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABARAPL3Q9BY60 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABARAPL3Q9BY60 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABARAPL3Q9BY60 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABARAPL3Q9BY60 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABARAPL3Q9BY60 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABARAPL3Q9BY60 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABARAPL3Q9BY60 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABARAPL3Q9BY60 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABARAPL3Q9BY60 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABARAPL3Q9BY60 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABARAPL3Q9BY60 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABARAPL3Q9BY60 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GABARAPL3Q9BY60 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GABARAPL3Q9BY60 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABARAPL3Q9BY60 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GABARAPL3Q9BY60 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GABARAPL3Q9BY60 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABARAPL3Q9BY60 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABARAPL3Q9BY60 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABARAPL3Q9BY60 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABARAPL3Q9BY60 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABARAPL3Q9BY60 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABARAPL3Q9BY60 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABARAPL3Q9BY60 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GABARAPL3Q9BY60 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABARAPL3Q9BY60 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABARAPL3Q9BY60 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GABARAPL3Q9BY60 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABARAPL3Q9BY60 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABARAPL3Q9BY60 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABARAPL3Q9BY60 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABARAPL3Q9BY60 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABARAPL3Q9BY60 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABARAPL3Q9BY60 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABARAPL3Q9BY60 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABARAPL3Q9BY60 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABARAPL3Q9BY60 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABARAPL3Q9BY60 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABARAPL3Q9BY60 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABARAPL3Q9BY60 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABARAPL3Q9BY60 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABARAPL3Q9BY60 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABARAPL3Q9BY60 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABARAPL3Q9BY60 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABARAPL3Q9BY60 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GABARAPL3Q9BY60 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABARAPL3Q9BY60 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABARAPL3Q9BY60 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABARAPL3Q9BY60 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABARAPL3Q9BY60 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABARAPL3Q9BY60 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABARAPL3Q9BY60 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABARAPL3Q9BY60 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABARAPL3Q9BY60 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABARAPL3Q9BY60 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABARAPL3Q9BY60 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABARAPL3Q9BY60 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABARAPL3Q9BY60 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABARAPL3Q9BY60 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABARAPL3Q9BY60 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABARAPL3Q9BY60 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABARAPL3Q9BY60 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABARAPL3Q9BY60 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABARAPL3Q9BY60 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABARAPL3Q9BY60 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABARAPL3Q9BY60 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABARAPL3Q9BY60 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABARAPL3Q9BY60 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms