Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC8Q9BY41 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC8Q9BY41 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC8Q9BY41 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC8Q9BY41 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC8Q9BY41 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC8Q9BY41 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC8Q9BY41 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC8Q9BY41 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC8Q9BY41 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC8Q9BY41 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDAC8Q9BY41 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HDAC8Q9BY41 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDAC8Q9BY41 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC8Q9BY41 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC8Q9BY41 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC8Q9BY41 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC8Q9BY41 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC8Q9BY41 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC8Q9BY41 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC8Q9BY41 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC8Q9BY41 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC8Q9BY41 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC8Q9BY41 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC8Q9BY41 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC8Q9BY41 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC8Q9BY41 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC8Q9BY41 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC8Q9BY41 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC8Q9BY41 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC8Q9BY41 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC8Q9BY41 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC8Q9BY41 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC8Q9BY41 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC8Q9BY41 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC8Q9BY41 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC8Q9BY41 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC8Q9BY41 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC8Q9BY41 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC8Q9BY41 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC8Q9BY41 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC8Q9BY41 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC8Q9BY41 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC8Q9BY41 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC8Q9BY41 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC8Q9BY41 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC8Q9BY41 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC8Q9BY41 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC8Q9BY41 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC8Q9BY41 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC8Q9BY41 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC8Q9BY41 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC8Q9BY41 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC8Q9BY41 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC8Q9BY41 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC8Q9BY41 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC8Q9BY41 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC8Q9BY41 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC8Q9BY41 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC8Q9BY41 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC8Q9BY41 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC8Q9BY41 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC8Q9BY41 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC8Q9BY41 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC8Q9BY41 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC8Q9BY41 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC8Q9BY41 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC8Q9BY41 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC8Q9BY41 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC8Q9BY41 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC8Q9BY41 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC8Q9BY41 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC8Q9BY41 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC8Q9BY41 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC8Q9BY41 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC8Q9BY41 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC8Q9BY41 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC8Q9BY41 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC8Q9BY41 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC8Q9BY41 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC8Q9BY41 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC8Q9BY41 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HDAC8Q9BY41 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HDAC8Q9BY41 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC8Q9BY41 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC8Q9BY41 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC8Q9BY41 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC8Q9BY41 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC8Q9BY41 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC8Q9BY41 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC8Q9BY41 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC8Q9BY41 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC8Q9BY41 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC8Q9BY41 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC8Q9BY41 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC8Q9BY41 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC8Q9BY41 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC8Q9BY41 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC8Q9BY41 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC8Q9BY41 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113 ms