Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC4A5Q9BY07 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC4A5Q9BY07 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC4A5Q9BY07 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC4A5Q9BY07 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC4A5Q9BY07 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC4A5Q9BY07 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC4A5Q9BY07 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC4A5Q9BY07 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC4A5Q9BY07 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC4A5Q9BY07 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC4A5Q9BY07 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC4A5Q9BY07 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A5Q9BY07 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A5Q9BY07 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A5Q9BY07 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A5Q9BY07 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A5Q9BY07 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A5Q9BY07 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A5Q9BY07 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC4A5Q9BY07 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC4A5Q9BY07 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC4A5Q9BY07 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC4A5Q9BY07 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC4A5Q9BY07 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC4A5Q9BY07 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC4A5Q9BY07 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC4A5Q9BY07 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC4A5Q9BY07 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SLC4A5Q9BY07 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC4A5Q9BY07 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC4A5Q9BY07 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC4A5Q9BY07 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC4A5Q9BY07 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC4A5Q9BY07 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC4A5Q9BY07 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC4A5Q9BY07 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC4A5Q9BY07 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC4A5Q9BY07 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC4A5Q9BY07 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC4A5Q9BY07 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A5Q9BY07 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A5Q9BY07 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A5Q9BY07 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A5Q9BY07 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A5Q9BY07 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A5Q9BY07 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A5Q9BY07 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A5Q9BY07 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A5Q9BY07 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A5Q9BY07 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A5Q9BY07 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A5Q9BY07 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A5Q9BY07 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A5Q9BY07 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A5Q9BY07 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A5Q9BY07 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A5Q9BY07 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A5Q9BY07 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A5Q9BY07 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A5Q9BY07 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A5Q9BY07 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A5Q9BY07 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A5Q9BY07 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A5Q9BY07 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A5Q9BY07 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A5Q9BY07 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A5Q9BY07 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A5Q9BY07 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A5Q9BY07 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A5Q9BY07 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A5Q9BY07 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A5Q9BY07 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A5Q9BY07 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A5Q9BY07 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A5Q9BY07 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A5Q9BY07 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A5Q9BY07 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A5Q9BY07 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC4A5Q9BY07 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC4A5Q9BY07 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC4A5Q9BY07 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC4A5Q9BY07 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLC4A5Q9BY07 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC4A5Q9BY07 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC4A5Q9BY07 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC4A5Q9BY07 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC4A5Q9BY07 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC4A5Q9BY07 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC4A5Q9BY07 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC4A5Q9BY07 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC4A5Q9BY07 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC4A5Q9BY07 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC4A5Q9BY07 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC4A5Q9BY07 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC4A5Q9BY07 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC4A5Q9BY07 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC4A5Q9BY07 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC4A5Q9BY07 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC4A5Q9BY07 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms