Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TDRD1Q9BXT4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TDRD1Q9BXT4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TDRD1Q9BXT4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TDRD1Q9BXT4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TDRD1Q9BXT4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TDRD1Q9BXT4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TDRD1Q9BXT4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TDRD1Q9BXT4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TDRD1Q9BXT4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TDRD1Q9BXT4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TDRD1Q9BXT4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TDRD1Q9BXT4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TDRD1Q9BXT4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TDRD1Q9BXT4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TDRD1Q9BXT4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TDRD1Q9BXT4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TDRD1Q9BXT4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TDRD1Q9BXT4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TDRD1Q9BXT4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TDRD1Q9BXT4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TDRD1Q9BXT4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TDRD1Q9BXT4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TDRD1Q9BXT4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TDRD1Q9BXT4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TDRD1Q9BXT4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TDRD1Q9BXT4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TDRD1Q9BXT4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TDRD1Q9BXT4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TDRD1Q9BXT4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TDRD1Q9BXT4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TDRD1Q9BXT4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TDRD1Q9BXT4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TDRD1Q9BXT4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TDRD1Q9BXT4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TDRD1Q9BXT4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TDRD1Q9BXT4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TDRD1Q9BXT4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TDRD1Q9BXT4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TDRD1Q9BXT4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TDRD1Q9BXT4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TDRD1Q9BXT4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TDRD1Q9BXT4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TDRD1Q9BXT4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TDRD1Q9BXT4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TDRD1Q9BXT4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TDRD1Q9BXT4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TDRD1Q9BXT4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TDRD1Q9BXT4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TDRD1Q9BXT4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TDRD1Q9BXT4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TDRD1Q9BXT4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TDRD1Q9BXT4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TDRD1Q9BXT4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TDRD1Q9BXT4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TDRD1Q9BXT4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TDRD1Q9BXT4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TDRD1Q9BXT4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TDRD1Q9BXT4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TDRD1Q9BXT4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TDRD1Q9BXT4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TDRD1Q9BXT4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TDRD1Q9BXT4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDRD1Q9BXT4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDRD1Q9BXT4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDRD1Q9BXT4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TDRD1Q9BXT4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDRD1Q9BXT4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDRD1Q9BXT4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDRD1Q9BXT4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TDRD1Q9BXT4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TDRD1Q9BXT4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TDRD1Q9BXT4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TDRD1Q9BXT4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TDRD1Q9BXT4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TDRD1Q9BXT4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TDRD1Q9BXT4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TDRD1Q9BXT4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TDRD1Q9BXT4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TDRD1Q9BXT4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TDRD1Q9BXT4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TDRD1Q9BXT4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TDRD1Q9BXT4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TDRD1Q9BXT4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TDRD1Q9BXT4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TDRD1Q9BXT4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TDRD1Q9BXT4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TDRD1Q9BXT4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TDRD1Q9BXT4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TDRD1Q9BXT4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TDRD1Q9BXT4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TDRD1Q9BXT4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TDRD1Q9BXT4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TDRD1Q9BXT4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TDRD1Q9BXT4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TDRD1Q9BXT4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TDRD1Q9BXT4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TDRD1Q9BXT4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TDRD1Q9BXT4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TDRD1Q9BXT4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms