Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LSM14BQ9BX40 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LSM14BQ9BX40 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LSM14BQ9BX40 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LSM14BQ9BX40 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LSM14BQ9BX40 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LSM14BQ9BX40 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LSM14BQ9BX40 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LSM14BQ9BX40 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LSM14BQ9BX40 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LSM14BQ9BX40 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LSM14BQ9BX40 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LSM14BQ9BX40 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LSM14BQ9BX40 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LSM14BQ9BX40 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LSM14BQ9BX40 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LSM14BQ9BX40 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LSM14BQ9BX40 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LSM14BQ9BX40 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LSM14BQ9BX40 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LSM14BQ9BX40 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LSM14BQ9BX40 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LSM14BQ9BX40 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LSM14BQ9BX40 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LSM14BQ9BX40 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LSM14BQ9BX40 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LSM14BQ9BX40 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LSM14BQ9BX40 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LSM14BQ9BX40 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LSM14BQ9BX40 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LSM14BQ9BX40 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LSM14BQ9BX40 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LSM14BQ9BX40 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LSM14BQ9BX40 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LSM14BQ9BX40 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LSM14BQ9BX40 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LSM14BQ9BX40 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LSM14BQ9BX40 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LSM14BQ9BX40 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LSM14BQ9BX40 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LSM14BQ9BX40 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LSM14BQ9BX40 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LSM14BQ9BX40 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LSM14BQ9BX40 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LSM14BQ9BX40 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LSM14BQ9BX40 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LSM14BQ9BX40 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LSM14BQ9BX40 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
LSM14BQ9BX40 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LSM14BQ9BX40 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LSM14BQ9BX40 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LSM14BQ9BX40 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LSM14BQ9BX40 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LSM14BQ9BX40 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LSM14BQ9BX40 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LSM14BQ9BX40 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LSM14BQ9BX40 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LSM14BQ9BX40 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LSM14BQ9BX40 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LSM14BQ9BX40 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LSM14BQ9BX40 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LSM14BQ9BX40 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LSM14BQ9BX40 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LSM14BQ9BX40 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LSM14BQ9BX40 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LSM14BQ9BX40 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LSM14BQ9BX40 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LSM14BQ9BX40 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LSM14BQ9BX40 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LSM14BQ9BX40 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LSM14BQ9BX40 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
LSM14BQ9BX40 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LSM14BQ9BX40 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LSM14BQ9BX40 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LSM14BQ9BX40 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LSM14BQ9BX40 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LSM14BQ9BX40 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LSM14BQ9BX40 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LSM14BQ9BX40 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LSM14BQ9BX40 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LSM14BQ9BX40 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LSM14BQ9BX40 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LSM14BQ9BX40 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LSM14BQ9BX40 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LSM14BQ9BX40 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LSM14BQ9BX40 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LSM14BQ9BX40 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LSM14BQ9BX40 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LSM14BQ9BX40 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LSM14BQ9BX40 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LSM14BQ9BX40 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LSM14BQ9BX40 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LSM14BQ9BX40 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LSM14BQ9BX40 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
LSM14BQ9BX40 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LSM14BQ9BX40 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LSM14BQ9BX40 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LSM14BQ9BX40 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LSM14BQ9BX40 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LSM14BQ9BX40 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.2 ms