Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GATA5Q9BWX5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GATA5Q9BWX5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GATA5Q9BWX5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GATA5Q9BWX5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GATA5Q9BWX5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GATA5Q9BWX5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GATA5Q9BWX5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GATA5Q9BWX5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GATA5Q9BWX5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GATA5Q9BWX5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GATA5Q9BWX5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GATA5Q9BWX5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GATA5Q9BWX5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GATA5Q9BWX5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GATA5Q9BWX5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GATA5Q9BWX5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GATA5Q9BWX5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GATA5Q9BWX5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GATA5Q9BWX5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GATA5Q9BWX5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GATA5Q9BWX5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GATA5Q9BWX5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GATA5Q9BWX5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GATA5Q9BWX5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GATA5Q9BWX5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GATA5Q9BWX5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GATA5Q9BWX5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GATA5Q9BWX5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GATA5Q9BWX5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GATA5Q9BWX5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GATA5Q9BWX5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GATA5Q9BWX5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GATA5Q9BWX5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GATA5Q9BWX5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GATA5Q9BWX5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GATA5Q9BWX5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GATA5Q9BWX5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GATA5Q9BWX5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GATA5Q9BWX5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GATA5Q9BWX5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GATA5Q9BWX5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GATA5Q9BWX5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GATA5Q9BWX5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GATA5Q9BWX5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GATA5Q9BWX5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GATA5Q9BWX5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GATA5Q9BWX5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GATA5Q9BWX5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GATA5Q9BWX5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GATA5Q9BWX5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GATA5Q9BWX5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GATA5Q9BWX5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GATA5Q9BWX5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GATA5Q9BWX5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GATA5Q9BWX5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GATA5Q9BWX5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GATA5Q9BWX5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GATA5Q9BWX5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GATA5Q9BWX5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GATA5Q9BWX5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GATA5Q9BWX5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GATA5Q9BWX5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GATA5Q9BWX5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GATA5Q9BWX5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GATA5Q9BWX5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GATA5Q9BWX5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GATA5Q9BWX5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GATA5Q9BWX5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GATA5Q9BWX5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GATA5Q9BWX5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GATA5Q9BWX5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GATA5Q9BWX5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GATA5Q9BWX5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GATA5Q9BWX5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GATA5Q9BWX5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GATA5Q9BWX5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GATA5Q9BWX5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GATA5Q9BWX5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GATA5Q9BWX5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GATA5Q9BWX5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GATA5Q9BWX5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GATA5Q9BWX5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GATA5Q9BWX5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GATA5Q9BWX5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GATA5Q9BWX5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GATA5Q9BWX5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GATA5Q9BWX5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GATA5Q9BWX5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GATA5Q9BWX5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GATA5Q9BWX5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GATA5Q9BWX5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GATA5Q9BWX5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GATA5Q9BWX5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GATA5Q9BWX5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GATA5Q9BWX5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GATA5Q9BWX5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GATA5Q9BWX5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GATA5Q9BWX5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GATA5Q9BWX5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms