Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
REPIN1Q9BWE0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
REPIN1Q9BWE0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
REPIN1Q9BWE0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
REPIN1Q9BWE0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
REPIN1Q9BWE0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
REPIN1Q9BWE0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
REPIN1Q9BWE0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
REPIN1Q9BWE0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
REPIN1Q9BWE0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
REPIN1Q9BWE0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
REPIN1Q9BWE0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
REPIN1Q9BWE0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
REPIN1Q9BWE0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
REPIN1Q9BWE0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
REPIN1Q9BWE0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
REPIN1Q9BWE0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
REPIN1Q9BWE0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
REPIN1Q9BWE0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
REPIN1Q9BWE0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
REPIN1Q9BWE0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
REPIN1Q9BWE0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
REPIN1Q9BWE0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
REPIN1Q9BWE0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
REPIN1Q9BWE0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
REPIN1Q9BWE0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
REPIN1Q9BWE0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
REPIN1Q9BWE0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
REPIN1Q9BWE0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
REPIN1Q9BWE0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
REPIN1Q9BWE0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
REPIN1Q9BWE0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
REPIN1Q9BWE0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
REPIN1Q9BWE0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
REPIN1Q9BWE0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
REPIN1Q9BWE0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
REPIN1Q9BWE0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
REPIN1Q9BWE0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
REPIN1Q9BWE0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
REPIN1Q9BWE0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
REPIN1Q9BWE0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
REPIN1Q9BWE0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
REPIN1Q9BWE0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
REPIN1Q9BWE0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
REPIN1Q9BWE0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
REPIN1Q9BWE0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
REPIN1Q9BWE0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
REPIN1Q9BWE0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
REPIN1Q9BWE0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
REPIN1Q9BWE0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
REPIN1Q9BWE0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
REPIN1Q9BWE0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
REPIN1Q9BWE0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
REPIN1Q9BWE0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
REPIN1Q9BWE0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
REPIN1Q9BWE0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
REPIN1Q9BWE0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
REPIN1Q9BWE0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
REPIN1Q9BWE0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
REPIN1Q9BWE0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
REPIN1Q9BWE0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
REPIN1Q9BWE0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
REPIN1Q9BWE0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
REPIN1Q9BWE0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
REPIN1Q9BWE0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
REPIN1Q9BWE0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
REPIN1Q9BWE0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
REPIN1Q9BWE0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
REPIN1Q9BWE0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
REPIN1Q9BWE0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
REPIN1Q9BWE0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
REPIN1Q9BWE0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
REPIN1Q9BWE0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
REPIN1Q9BWE0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
REPIN1Q9BWE0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
REPIN1Q9BWE0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
REPIN1Q9BWE0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
REPIN1Q9BWE0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
REPIN1Q9BWE0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.32■■□□□ 1
REPIN1Q9BWE0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
REPIN1Q9BWE0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
REPIN1Q9BWE0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
REPIN1Q9BWE0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
REPIN1Q9BWE0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
REPIN1Q9BWE0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
REPIN1Q9BWE0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
REPIN1Q9BWE0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
REPIN1Q9BWE0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REPIN1Q9BWE0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REPIN1Q9BWE0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REPIN1Q9BWE0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
REPIN1Q9BWE0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
REPIN1Q9BWE0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
REPIN1Q9BWE0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REPIN1Q9BWE0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REPIN1Q9BWE0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REPIN1Q9BWE0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REPIN1Q9BWE0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REPIN1Q9BWE0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REPIN1Q9BWE0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms