Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM43Q9BTV4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM43Q9BTV4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM43Q9BTV4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM43Q9BTV4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM43Q9BTV4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM43Q9BTV4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM43Q9BTV4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM43Q9BTV4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM43Q9BTV4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM43Q9BTV4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM43Q9BTV4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM43Q9BTV4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM43Q9BTV4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM43Q9BTV4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM43Q9BTV4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM43Q9BTV4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM43Q9BTV4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM43Q9BTV4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM43Q9BTV4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM43Q9BTV4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM43Q9BTV4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM43Q9BTV4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM43Q9BTV4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM43Q9BTV4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM43Q9BTV4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM43Q9BTV4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM43Q9BTV4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM43Q9BTV4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM43Q9BTV4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM43Q9BTV4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM43Q9BTV4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM43Q9BTV4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM43Q9BTV4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM43Q9BTV4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM43Q9BTV4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM43Q9BTV4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM43Q9BTV4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM43Q9BTV4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM43Q9BTV4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM43Q9BTV4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM43Q9BTV4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM43Q9BTV4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM43Q9BTV4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM43Q9BTV4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM43Q9BTV4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM43Q9BTV4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM43Q9BTV4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM43Q9BTV4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM43Q9BTV4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM43Q9BTV4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM43Q9BTV4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM43Q9BTV4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM43Q9BTV4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM43Q9BTV4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM43Q9BTV4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM43Q9BTV4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM43Q9BTV4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM43Q9BTV4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM43Q9BTV4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM43Q9BTV4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM43Q9BTV4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM43Q9BTV4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM43Q9BTV4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM43Q9BTV4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM43Q9BTV4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM43Q9BTV4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM43Q9BTV4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM43Q9BTV4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM43Q9BTV4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM43Q9BTV4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM43Q9BTV4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM43Q9BTV4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM43Q9BTV4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM43Q9BTV4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM43Q9BTV4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM43Q9BTV4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM43Q9BTV4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM43Q9BTV4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM43Q9BTV4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM43Q9BTV4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM43Q9BTV4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM43Q9BTV4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM43Q9BTV4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM43Q9BTV4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM43Q9BTV4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM43Q9BTV4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM43Q9BTV4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM43Q9BTV4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM43Q9BTV4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM43Q9BTV4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM43Q9BTV4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM43Q9BTV4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM43Q9BTV4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM43Q9BTV4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM43Q9BTV4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM43Q9BTV4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM43Q9BTV4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM43Q9BTV4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM43Q9BTV4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms