Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
RBM42Q9BTD8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
RBM42Q9BTD8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RBM42Q9BTD8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RBM42Q9BTD8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
RBM42Q9BTD8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
RBM42Q9BTD8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
RBM42Q9BTD8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
RBM42Q9BTD8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
RBM42Q9BTD8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
RBM42Q9BTD8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
RBM42Q9BTD8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
RBM42Q9BTD8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
RBM42Q9BTD8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
RBM42Q9BTD8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
RBM42Q9BTD8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
RBM42Q9BTD8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
RBM42Q9BTD8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
RBM42Q9BTD8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
RBM42Q9BTD8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
RBM42Q9BTD8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
RBM42Q9BTD8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
RBM42Q9BTD8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
RBM42Q9BTD8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
RBM42Q9BTD8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
RBM42Q9BTD8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
RBM42Q9BTD8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RBM42Q9BTD8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
RBM42Q9BTD8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
RBM42Q9BTD8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
RBM42Q9BTD8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
RBM42Q9BTD8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
RBM42Q9BTD8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
RBM42Q9BTD8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
RBM42Q9BTD8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
RBM42Q9BTD8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
RBM42Q9BTD8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RBM42Q9BTD8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
RBM42Q9BTD8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
RBM42Q9BTD8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RBM42Q9BTD8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
RBM42Q9BTD8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
RBM42Q9BTD8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RBM42Q9BTD8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RBM42Q9BTD8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
RBM42Q9BTD8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RBM42Q9BTD8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RBM42Q9BTD8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
RBM42Q9BTD8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
RBM42Q9BTD8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
RBM42Q9BTD8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RBM42Q9BTD8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
RBM42Q9BTD8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RBM42Q9BTD8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RBM42Q9BTD8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
RBM42Q9BTD8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
RBM42Q9BTD8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
RBM42Q9BTD8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RBM42Q9BTD8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
RBM42Q9BTD8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
RBM42Q9BTD8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
RBM42Q9BTD8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
RBM42Q9BTD8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RBM42Q9BTD8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
RBM42Q9BTD8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RBM42Q9BTD8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
RBM42Q9BTD8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
RBM42Q9BTD8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RBM42Q9BTD8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RBM42Q9BTD8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC32.17■■■□□ 2.74
RBM42Q9BTD8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RBM42Q9BTD8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RBM42Q9BTD8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RBM42Q9BTD8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
RBM42Q9BTD8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RBM42Q9BTD8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RBM42Q9BTD8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RBM42Q9BTD8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RBM42Q9BTD8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RBM42Q9BTD8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
RBM42Q9BTD8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RBM42Q9BTD8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
RBM42Q9BTD8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
RBM42Q9BTD8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
RBM42Q9BTD8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
RBM42Q9BTD8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC32.13■■■□□ 2.73
RBM42Q9BTD8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RBM42Q9BTD8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RBM42Q9BTD8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
RBM42Q9BTD8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RBM42Q9BTD8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
RBM42Q9BTD8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RBM42Q9BTD8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RBM42Q9BTD8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RBM42Q9BTD8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RBM42Q9BTD8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RBM42Q9BTD8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RBM42Q9BTD8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RBM42Q9BTD8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RBM42Q9BTD8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
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