Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS16

CENPK, Centromere protein K, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPKQ9BS16 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPKQ9BS16 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPKQ9BS16 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPKQ9BS16 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPKQ9BS16 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPKQ9BS16 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPKQ9BS16 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPKQ9BS16 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPKQ9BS16 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPKQ9BS16 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPKQ9BS16 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPKQ9BS16 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPKQ9BS16 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPKQ9BS16 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPKQ9BS16 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPKQ9BS16 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPKQ9BS16 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPKQ9BS16 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPKQ9BS16 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPKQ9BS16 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPKQ9BS16 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPKQ9BS16 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPKQ9BS16 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPKQ9BS16 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPKQ9BS16 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPKQ9BS16 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPKQ9BS16 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPKQ9BS16 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPKQ9BS16 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPKQ9BS16 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPKQ9BS16 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPKQ9BS16 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPKQ9BS16 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPKQ9BS16 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPKQ9BS16 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPKQ9BS16 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPKQ9BS16 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPKQ9BS16 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPKQ9BS16 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPKQ9BS16 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPKQ9BS16 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPKQ9BS16 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPKQ9BS16 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPKQ9BS16 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPKQ9BS16 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPKQ9BS16 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPKQ9BS16 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPKQ9BS16 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPKQ9BS16 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPKQ9BS16 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPKQ9BS16 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPKQ9BS16 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPKQ9BS16 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPKQ9BS16 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPKQ9BS16 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPKQ9BS16 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPKQ9BS16 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPKQ9BS16 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPKQ9BS16 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPKQ9BS16 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPKQ9BS16 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPKQ9BS16 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPKQ9BS16 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPKQ9BS16 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPKQ9BS16 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPKQ9BS16 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPKQ9BS16 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPKQ9BS16 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPKQ9BS16 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPKQ9BS16 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPKQ9BS16 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPKQ9BS16 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPKQ9BS16 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPKQ9BS16 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPKQ9BS16 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CENPKQ9BS16 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CENPKQ9BS16 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CENPKQ9BS16 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CENPKQ9BS16 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CENPKQ9BS16 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPKQ9BS16 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPKQ9BS16 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPKQ9BS16 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPKQ9BS16 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPKQ9BS16 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPKQ9BS16 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPKQ9BS16 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPKQ9BS16 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPKQ9BS16 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPKQ9BS16 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPKQ9BS16 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPKQ9BS16 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPKQ9BS16 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPKQ9BS16 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPKQ9BS16 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPKQ9BS16 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPKQ9BS16 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPKQ9BS16 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPKQ9BS16 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPKQ9BS16 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms