Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP1

PDCD2L, Programmed cell death protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2LQ9BRP1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDCD2LQ9BRP1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDCD2LQ9BRP1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDCD2LQ9BRP1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PDCD2LQ9BRP1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDCD2LQ9BRP1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDCD2LQ9BRP1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDCD2LQ9BRP1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PDCD2LQ9BRP1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDCD2LQ9BRP1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDCD2LQ9BRP1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDCD2LQ9BRP1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDCD2LQ9BRP1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDCD2LQ9BRP1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDCD2LQ9BRP1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDCD2LQ9BRP1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDCD2LQ9BRP1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDCD2LQ9BRP1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDCD2LQ9BRP1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDCD2LQ9BRP1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDCD2LQ9BRP1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDCD2LQ9BRP1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDCD2LQ9BRP1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDCD2LQ9BRP1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDCD2LQ9BRP1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDCD2LQ9BRP1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PDCD2LQ9BRP1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDCD2LQ9BRP1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PDCD2LQ9BRP1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PDCD2LQ9BRP1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PDCD2LQ9BRP1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PDCD2LQ9BRP1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDCD2LQ9BRP1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PDCD2LQ9BRP1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDCD2LQ9BRP1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PDCD2LQ9BRP1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDCD2LQ9BRP1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDCD2LQ9BRP1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDCD2LQ9BRP1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDCD2LQ9BRP1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDCD2LQ9BRP1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDCD2LQ9BRP1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PDCD2LQ9BRP1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDCD2LQ9BRP1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PDCD2LQ9BRP1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PDCD2LQ9BRP1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDCD2LQ9BRP1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDCD2LQ9BRP1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDCD2LQ9BRP1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDCD2LQ9BRP1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDCD2LQ9BRP1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDCD2LQ9BRP1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDCD2LQ9BRP1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDCD2LQ9BRP1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDCD2LQ9BRP1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PDCD2LQ9BRP1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDCD2LQ9BRP1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PDCD2LQ9BRP1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PDCD2LQ9BRP1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDCD2LQ9BRP1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDCD2LQ9BRP1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDCD2LQ9BRP1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDCD2LQ9BRP1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDCD2LQ9BRP1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PDCD2LQ9BRP1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDCD2LQ9BRP1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
PDCD2LQ9BRP1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDCD2LQ9BRP1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PDCD2LQ9BRP1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDCD2LQ9BRP1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDCD2LQ9BRP1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDCD2LQ9BRP1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PDCD2LQ9BRP1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PDCD2LQ9BRP1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDCD2LQ9BRP1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDCD2LQ9BRP1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDCD2LQ9BRP1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDCD2LQ9BRP1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDCD2LQ9BRP1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDCD2LQ9BRP1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDCD2LQ9BRP1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDCD2LQ9BRP1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDCD2LQ9BRP1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDCD2LQ9BRP1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDCD2LQ9BRP1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDCD2LQ9BRP1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDCD2LQ9BRP1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDCD2LQ9BRP1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDCD2LQ9BRP1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDCD2LQ9BRP1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDCD2LQ9BRP1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDCD2LQ9BRP1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDCD2LQ9BRP1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDCD2LQ9BRP1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDCD2LQ9BRP1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PDCD2LQ9BRP1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PDCD2LQ9BRP1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDCD2LQ9BRP1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDCD2LQ9BRP1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDCD2LQ9BRP1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms