Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBA1CQ9BQE3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBA1CQ9BQE3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBA1CQ9BQE3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBA1CQ9BQE3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBA1CQ9BQE3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBA1CQ9BQE3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBA1CQ9BQE3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBA1CQ9BQE3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBA1CQ9BQE3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBA1CQ9BQE3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBA1CQ9BQE3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBA1CQ9BQE3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBA1CQ9BQE3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBA1CQ9BQE3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBA1CQ9BQE3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBA1CQ9BQE3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBA1CQ9BQE3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBA1CQ9BQE3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBA1CQ9BQE3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBA1CQ9BQE3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBA1CQ9BQE3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBA1CQ9BQE3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBA1CQ9BQE3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBA1CQ9BQE3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBA1CQ9BQE3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBA1CQ9BQE3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBA1CQ9BQE3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBA1CQ9BQE3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBA1CQ9BQE3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBA1CQ9BQE3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBA1CQ9BQE3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TUBA1CQ9BQE3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TUBA1CQ9BQE3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBA1CQ9BQE3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBA1CQ9BQE3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBA1CQ9BQE3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBA1CQ9BQE3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBA1CQ9BQE3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBA1CQ9BQE3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBA1CQ9BQE3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBA1CQ9BQE3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBA1CQ9BQE3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBA1CQ9BQE3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBA1CQ9BQE3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBA1CQ9BQE3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBA1CQ9BQE3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBA1CQ9BQE3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBA1CQ9BQE3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBA1CQ9BQE3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBA1CQ9BQE3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBA1CQ9BQE3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBA1CQ9BQE3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBA1CQ9BQE3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBA1CQ9BQE3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBA1CQ9BQE3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBA1CQ9BQE3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBA1CQ9BQE3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBA1CQ9BQE3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBA1CQ9BQE3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBA1CQ9BQE3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBA1CQ9BQE3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBA1CQ9BQE3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TUBA1CQ9BQE3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TUBA1CQ9BQE3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBA1CQ9BQE3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBA1CQ9BQE3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBA1CQ9BQE3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBA1CQ9BQE3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBA1CQ9BQE3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBA1CQ9BQE3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBA1CQ9BQE3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBA1CQ9BQE3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBA1CQ9BQE3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBA1CQ9BQE3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBA1CQ9BQE3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBA1CQ9BQE3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBA1CQ9BQE3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBA1CQ9BQE3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBA1CQ9BQE3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBA1CQ9BQE3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBA1CQ9BQE3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBA1CQ9BQE3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBA1CQ9BQE3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBA1CQ9BQE3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBA1CQ9BQE3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBA1CQ9BQE3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBA1CQ9BQE3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBA1CQ9BQE3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBA1CQ9BQE3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBA1CQ9BQE3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBA1CQ9BQE3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBA1CQ9BQE3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBA1CQ9BQE3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBA1CQ9BQE3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBA1CQ9BQE3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBA1CQ9BQE3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBA1CQ9BQE3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBA1CQ9BQE3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBA1CQ9BQE3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms