Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TREX2Q9BQ50 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TREX2Q9BQ50 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TREX2Q9BQ50 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TREX2Q9BQ50 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TREX2Q9BQ50 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TREX2Q9BQ50 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TREX2Q9BQ50 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TREX2Q9BQ50 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TREX2Q9BQ50 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TREX2Q9BQ50 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TREX2Q9BQ50 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TREX2Q9BQ50 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TREX2Q9BQ50 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TREX2Q9BQ50 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TREX2Q9BQ50 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TREX2Q9BQ50 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TREX2Q9BQ50 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TREX2Q9BQ50 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TREX2Q9BQ50 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TREX2Q9BQ50 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TREX2Q9BQ50 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TREX2Q9BQ50 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TREX2Q9BQ50 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TREX2Q9BQ50 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TREX2Q9BQ50 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TREX2Q9BQ50 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TREX2Q9BQ50 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TREX2Q9BQ50 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TREX2Q9BQ50 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TREX2Q9BQ50 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TREX2Q9BQ50 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TREX2Q9BQ50 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TREX2Q9BQ50 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TREX2Q9BQ50 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TREX2Q9BQ50 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TREX2Q9BQ50 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TREX2Q9BQ50 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TREX2Q9BQ50 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TREX2Q9BQ50 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TREX2Q9BQ50 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TREX2Q9BQ50 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TREX2Q9BQ50 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TREX2Q9BQ50 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TREX2Q9BQ50 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TREX2Q9BQ50 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TREX2Q9BQ50 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TREX2Q9BQ50 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TREX2Q9BQ50 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TREX2Q9BQ50 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TREX2Q9BQ50 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TREX2Q9BQ50 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TREX2Q9BQ50 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TREX2Q9BQ50 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TREX2Q9BQ50 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TREX2Q9BQ50 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TREX2Q9BQ50 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TREX2Q9BQ50 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TREX2Q9BQ50 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TREX2Q9BQ50 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TREX2Q9BQ50 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TREX2Q9BQ50 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TREX2Q9BQ50 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TREX2Q9BQ50 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TREX2Q9BQ50 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TREX2Q9BQ50 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TREX2Q9BQ50 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TREX2Q9BQ50 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TREX2Q9BQ50 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TREX2Q9BQ50 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TREX2Q9BQ50 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TREX2Q9BQ50 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TREX2Q9BQ50 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TREX2Q9BQ50 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TREX2Q9BQ50 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TREX2Q9BQ50 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TREX2Q9BQ50 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TREX2Q9BQ50 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TREX2Q9BQ50 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TREX2Q9BQ50 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TREX2Q9BQ50 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TREX2Q9BQ50 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TREX2Q9BQ50 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TREX2Q9BQ50 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TREX2Q9BQ50 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TREX2Q9BQ50 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TREX2Q9BQ50 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TREX2Q9BQ50 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TREX2Q9BQ50 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TREX2Q9BQ50 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TREX2Q9BQ50 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TREX2Q9BQ50 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TREX2Q9BQ50 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TREX2Q9BQ50 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TREX2Q9BQ50 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TREX2Q9BQ50 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TREX2Q9BQ50 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TREX2Q9BQ50 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TREX2Q9BQ50 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TREX2Q9BQ50 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 199.6 ms