Protein–RNA interactions for Protein: Q99675

CGRRF1, Cell growth regulator with RING finger domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGRRF1Q99675 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CGRRF1Q99675 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CGRRF1Q99675 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CGRRF1Q99675 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CGRRF1Q99675 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CGRRF1Q99675 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CGRRF1Q99675 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CGRRF1Q99675 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CGRRF1Q99675 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CGRRF1Q99675 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CGRRF1Q99675 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CGRRF1Q99675 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CGRRF1Q99675 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CGRRF1Q99675 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CGRRF1Q99675 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CGRRF1Q99675 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CGRRF1Q99675 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CGRRF1Q99675 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CGRRF1Q99675 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CGRRF1Q99675 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CGRRF1Q99675 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CGRRF1Q99675 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CGRRF1Q99675 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CGRRF1Q99675 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CGRRF1Q99675 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CGRRF1Q99675 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CGRRF1Q99675 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CGRRF1Q99675 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CGRRF1Q99675 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CGRRF1Q99675 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CGRRF1Q99675 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CGRRF1Q99675 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CGRRF1Q99675 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CGRRF1Q99675 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CGRRF1Q99675 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CGRRF1Q99675 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CGRRF1Q99675 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CGRRF1Q99675 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CGRRF1Q99675 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CGRRF1Q99675 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CGRRF1Q99675 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CGRRF1Q99675 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CGRRF1Q99675 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CGRRF1Q99675 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CGRRF1Q99675 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CGRRF1Q99675 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CGRRF1Q99675 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CGRRF1Q99675 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CGRRF1Q99675 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CGRRF1Q99675 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CGRRF1Q99675 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CGRRF1Q99675 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CGRRF1Q99675 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CGRRF1Q99675 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CGRRF1Q99675 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CGRRF1Q99675 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CGRRF1Q99675 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CGRRF1Q99675 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CGRRF1Q99675 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CGRRF1Q99675 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CGRRF1Q99675 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CGRRF1Q99675 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CGRRF1Q99675 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CGRRF1Q99675 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CGRRF1Q99675 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CGRRF1Q99675 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CGRRF1Q99675 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CGRRF1Q99675 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CGRRF1Q99675 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CGRRF1Q99675 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CGRRF1Q99675 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CGRRF1Q99675 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CGRRF1Q99675 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CGRRF1Q99675 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CGRRF1Q99675 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CGRRF1Q99675 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CGRRF1Q99675 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CGRRF1Q99675 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CGRRF1Q99675 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CGRRF1Q99675 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CGRRF1Q99675 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CGRRF1Q99675 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CGRRF1Q99675 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CGRRF1Q99675 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CGRRF1Q99675 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CGRRF1Q99675 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CGRRF1Q99675 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CGRRF1Q99675 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CGRRF1Q99675 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CGRRF1Q99675 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CGRRF1Q99675 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CGRRF1Q99675 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CGRRF1Q99675 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CGRRF1Q99675 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CGRRF1Q99675 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CGRRF1Q99675 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CGRRF1Q99675 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CGRRF1Q99675 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CGRRF1Q99675 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CGRRF1Q99675 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms