Protein–RNA interactions for Protein: Q99325

ATG40, Autophagy-related protein 40, yeastyeast

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG40Q99325 NTG1YAL015C 1200 nt5.8□□□□□ -1.48
ATG40Q99325 YOX1YML027W 1158 nt5.8□□□□□ -1.48
ATG40Q99325 SPG5YMR191W 1122 nt5.8□□□□□ -1.48
ATG40Q99325 SMK1YPR054W 1167 nt5.8□□□□□ -1.48
ATG40Q99325 HOG1YLR113W 1308 nt5.79□□□□□ -1.48
ATG40Q99325 TUF1YOR187W 1314 nt5.79□□□□□ -1.48
ATG40Q99325 ERS1YCR075C 783 nt5.79□□□□□ -1.48
ATG40Q99325 YLR162WYLR162W 357 nt5.79□□□□□ -1.48
ATG40Q99325 PAC2YER007W 1557 nt5.79□□□□□ -1.48
ATG40Q99325 YMR034CYMR034C 1305 nt5.78□□□□□ -1.48
ATG40Q99325 CYS3YAL012W 1185 nt5.78□□□□□ -1.48
ATG40Q99325 RDN5-2RDN5-2 119 nt5.78□□□□□ -1.48
ATG40Q99325 RDN5-3RDN5-3 119 nt5.78□□□□□ -1.48
ATG40Q99325 RDN5-4RDN5-4 119 nt5.78□□□□□ -1.48
ATG40Q99325 RDN5-5RDN5-5 119 nt5.78□□□□□ -1.48
ATG40Q99325 YPL247CYPL247C 1572 nt5.78□□□□□ -1.48
ATG40Q99325 TRS31YDR472W 852 nt5.77□□□□□ -1.49
ATG40Q99325 REC107YJR021C 945 nt5.77□□□□□ -1.49
ATG40Q99325 OPI11YPR044C 354 nt5.77□□□□□ -1.49
ATG40Q99325 CCT3YJL014W 1605 nt5.77□□□□□ -1.49
ATG40Q99325 YIP4YGL198W 708 nt5.76□□□□□ -1.49
ATG40Q99325 AIM46YHR199C 933 nt5.76□□□□□ -1.49
ATG40Q99325 ECM30YLR436C 3825 nt5.76□□□□□ -1.49
ATG40Q99325 YBR241CYBR241C 1467 nt5.76□□□□□ -1.49
ATG40Q99325 EMP65YER140W 1671 nt5.75□□□□□ -1.49
ATG40Q99325 MRPS28YDR337W 861 nt5.75□□□□□ -1.49
ATG40Q99325 SML1YML058W 315 nt5.75□□□□□ -1.49
ATG40Q99325 FIT2YOR382W 462 nt5.75□□□□□ -1.49
ATG40Q99325 MFG1YDL233W 1377 nt5.75□□□□□ -1.49
ATG40Q99325 YJL163CYJL163C 1668 nt5.75□□□□□ -1.49
ATG40Q99325 YSC83YHR017W 1158 nt5.74□□□□□ -1.49
ATG40Q99325 CTF8YHR191C 402 nt5.74□□□□□ -1.49
ATG40Q99325 ERG10YPL028W 1197 nt5.74□□□□□ -1.49
ATG40Q99325 SMC5YOL034W 3282 nt5.73□□□□□ -1.49
ATG40Q99325 YDL177CYDL177C 513 nt5.73□□□□□ -1.49
ATG40Q99325 YNR014WYNR014W 639 nt5.73□□□□□ -1.49
ATG40Q99325 GSH1YJL101C 2037 nt5.73□□□□□ -1.49
ATG40Q99325 PUS7YOR243C 2031 nt5.73□□□□□ -1.49
ATG40Q99325 SKY1YMR216C 2229 nt5.72□□□□□ -1.49
ATG40Q99325 GPH1YPR160W 2709 nt5.72□□□□□ -1.49
ATG40Q99325 YLL058WYLL058W 1728 nt5.72□□□□□ -1.49
ATG40Q99325 PPH22YDL188C 1134 nt5.72□□□□□ -1.49
ATG40Q99325 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt5.72□□□□□ -1.49
ATG40Q99325 YGL102CYGL102C 429 nt5.72□□□□□ -1.49
ATG40Q99325 PRI1YIR008C 1230 nt5.72□□□□□ -1.49
ATG40Q99325 RPL31BYLR406C 342 nt5.72□□□□□ -1.49
ATG40Q99325 MRPL19YNL185C 477 nt5.72□□□□□ -1.49
ATG40Q99325 TMA46YOR091W 1038 nt5.72□□□□□ -1.49
ATG40Q99325 CLN1YMR199W 1641 nt5.72□□□□□ -1.49
ATG40Q99325 SLA2YNL243W 2907 nt5.72□□□□□ -1.49
ATG40Q99325 GTT3YEL017W 1014 nt5.71□□□□□ -1.5
ATG40Q99325 COX16YJL003W 357 nt5.71□□□□□ -1.5
ATG40Q99325 YLL056CYLL056C 897 nt5.71□□□□□ -1.5
ATG40Q99325 YPR076WYPR076W 375 nt5.71□□□□□ -1.5
ATG40Q99325 SMX3YPR182W 261 nt5.71□□□□□ -1.5
ATG40Q99325 RGD2YFL047W 2145 nt5.71□□□□□ -1.5
ATG40Q99325 COX15YER141W 1461 nt5.71□□□□□ -1.5
ATG40Q99325 URH1YDR400W 1023 nt5.7□□□□□ -1.5
ATG40Q99325 GCN3YKR026C 918 nt5.7□□□□□ -1.5
ATG40Q99325 SWD1YAR003W 1281 nt5.7□□□□□ -1.5
ATG40Q99325 AAD14YNL331C 1131 nt5.7□□□□□ -1.5
ATG40Q99325 PRP2YNR011C 2631 nt5.7□□□□□ -1.5
ATG40Q99325 NUP49YGL172W 1419 nt5.69□□□□□ -1.5
ATG40Q99325 ZIM17YNL310C 525 nt5.69□□□□□ -1.5
ATG40Q99325 YOL046CYOL046C 675 nt5.69□□□□□ -1.5
ATG40Q99325 RSP5YER125W 2430 nt5.69□□□□□ -1.5
ATG40Q99325 ICP55YER078C 1536 nt5.69□□□□□ -1.5
ATG40Q99325 SGE1YPR198W 1632 nt5.68□□□□□ -1.5
ATG40Q99325 HIS1YER055C 894 nt5.68□□□□□ -1.5
ATG40Q99325 CBR1YIL043C 855 nt5.68□□□□□ -1.5
ATG40Q99325 MCP1YOR228C 909 nt5.68□□□□□ -1.5
ATG40Q99325 ADE17YMR120C 1779 nt5.67□□□□□ -1.5
ATG40Q99325 PPH21YDL134C 1110 nt5.67□□□□□ -1.5
ATG40Q99325 FPR2YDR519W 408 nt5.67□□□□□ -1.5
ATG40Q99325 HMS2YJR147W 1077 nt5.67□□□□□ -1.5
ATG40Q99325 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt5.67□□□□□ -1.5
ATG40Q99325 ASR1YPR093C 867 nt5.67□□□□□ -1.5
ATG40Q99325 YLL066CYLL066C 3618 nt5.67□□□□□ -1.5
ATG40Q99325 YHR020WYHR020W 2067 nt5.67□□□□□ -1.5
ATG40Q99325 MSC3YLR219W 2187 nt5.66□□□□□ -1.5
ATG40Q99325 TPK1YJL164C 1194 nt5.66□□□□□ -1.5
ATG40Q99325 SUR7YML052W 909 nt5.66□□□□□ -1.5
ATG40Q99325 LGE1YPL055C 999 nt5.66□□□□□ -1.5
ATG40Q99325 PPM2YOL141W 2088 nt5.66□□□□□ -1.5
ATG40Q99325 MLS1YNL117W 1665 nt5.66□□□□□ -1.5
ATG40Q99325 HSP12YFL014W 330 nt5.65□□□□□ -1.5
ATG40Q99325 AGX1YFL030W 1158 nt5.65□□□□□ -1.5
ATG40Q99325 OPI8YKR035C 642 nt5.65□□□□□ -1.5
ATG40Q99325 IRC11YOR013W 471 nt5.65□□□□□ -1.5
ATG40Q99325 ECM38YLR299W 1983 nt5.65□□□□□ -1.51
ATG40Q99325 ARP3YJR065C 1350 nt5.65□□□□□ -1.51
ATG40Q99325 FCY22YER060W-A 1593 nt5.64□□□□□ -1.51
ATG40Q99325 YKR032WYKR032W 315 nt5.64□□□□□ -1.51
ATG40Q99325 CUE4YML101C 354 nt5.64□□□□□ -1.51
ATG40Q99325 RPL5YPL131W 894 nt5.64□□□□□ -1.51
ATG40Q99325 PEX31YGR004W 1389 nt5.64□□□□□ -1.51
ATG40Q99325 HED1YDR014W-A 489 nt5.63□□□□□ -1.51
ATG40Q99325 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt5.63□□□□□ -1.51
ATG40Q99325 SUF16tG(GCC)C 71 nt5.63□□□□□ -1.51
ATG40Q99325 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.1 ms