Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB4

SRPK1, SRSF protein kinase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK1Q96SB4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRPK1Q96SB4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRPK1Q96SB4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRPK1Q96SB4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SRPK1Q96SB4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRPK1Q96SB4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRPK1Q96SB4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRPK1Q96SB4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRPK1Q96SB4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRPK1Q96SB4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRPK1Q96SB4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRPK1Q96SB4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRPK1Q96SB4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRPK1Q96SB4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRPK1Q96SB4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRPK1Q96SB4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRPK1Q96SB4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRPK1Q96SB4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRPK1Q96SB4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRPK1Q96SB4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRPK1Q96SB4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRPK1Q96SB4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRPK1Q96SB4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRPK1Q96SB4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRPK1Q96SB4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRPK1Q96SB4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRPK1Q96SB4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRPK1Q96SB4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRPK1Q96SB4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRPK1Q96SB4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRPK1Q96SB4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRPK1Q96SB4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRPK1Q96SB4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRPK1Q96SB4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SRPK1Q96SB4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SRPK1Q96SB4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRPK1Q96SB4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRPK1Q96SB4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRPK1Q96SB4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRPK1Q96SB4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRPK1Q96SB4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRPK1Q96SB4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRPK1Q96SB4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRPK1Q96SB4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRPK1Q96SB4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRPK1Q96SB4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRPK1Q96SB4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRPK1Q96SB4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRPK1Q96SB4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SRPK1Q96SB4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRPK1Q96SB4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRPK1Q96SB4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRPK1Q96SB4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRPK1Q96SB4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRPK1Q96SB4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRPK1Q96SB4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRPK1Q96SB4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRPK1Q96SB4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SRPK1Q96SB4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRPK1Q96SB4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRPK1Q96SB4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRPK1Q96SB4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRPK1Q96SB4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRPK1Q96SB4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRPK1Q96SB4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SRPK1Q96SB4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRPK1Q96SB4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRPK1Q96SB4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRPK1Q96SB4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRPK1Q96SB4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRPK1Q96SB4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRPK1Q96SB4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRPK1Q96SB4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRPK1Q96SB4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SRPK1Q96SB4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRPK1Q96SB4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRPK1Q96SB4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRPK1Q96SB4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRPK1Q96SB4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRPK1Q96SB4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRPK1Q96SB4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRPK1Q96SB4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRPK1Q96SB4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRPK1Q96SB4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRPK1Q96SB4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SRPK1Q96SB4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRPK1Q96SB4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRPK1Q96SB4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRPK1Q96SB4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRPK1Q96SB4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRPK1Q96SB4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRPK1Q96SB4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRPK1Q96SB4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRPK1Q96SB4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRPK1Q96SB4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRPK1Q96SB4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRPK1Q96SB4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRPK1Q96SB4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRPK1Q96SB4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRPK1Q96SB4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.4 ms