Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC9Q96Q05 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC9Q96Q05 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC9Q96Q05 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC9Q96Q05 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC9Q96Q05 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC9Q96Q05 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC9Q96Q05 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC9Q96Q05 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC9Q96Q05 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC9Q96Q05 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC9Q96Q05 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC9Q96Q05 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC9Q96Q05 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC9Q96Q05 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC9Q96Q05 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC9Q96Q05 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC9Q96Q05 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC9Q96Q05 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC9Q96Q05 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC9Q96Q05 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC9Q96Q05 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC9Q96Q05 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC9Q96Q05 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC9Q96Q05 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC9Q96Q05 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC9Q96Q05 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC9Q96Q05 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC9Q96Q05 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC9Q96Q05 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC9Q96Q05 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC9Q96Q05 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC9Q96Q05 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC9Q96Q05 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC9Q96Q05 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC9Q96Q05 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC9Q96Q05 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC9Q96Q05 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC9Q96Q05 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC9Q96Q05 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC9Q96Q05 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC9Q96Q05 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC9Q96Q05 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC9Q96Q05 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC9Q96Q05 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC9Q96Q05 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC9Q96Q05 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC9Q96Q05 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC9Q96Q05 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC9Q96Q05 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC9Q96Q05 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC9Q96Q05 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC9Q96Q05 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC9Q96Q05 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC9Q96Q05 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC9Q96Q05 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC9Q96Q05 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC9Q96Q05 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC9Q96Q05 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC9Q96Q05 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC9Q96Q05 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC9Q96Q05 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC9Q96Q05 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC9Q96Q05 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC9Q96Q05 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC9Q96Q05 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC9Q96Q05 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC9Q96Q05 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC9Q96Q05 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC9Q96Q05 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC9Q96Q05 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC9Q96Q05 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC9Q96Q05 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC9Q96Q05 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC9Q96Q05 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC9Q96Q05 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC9Q96Q05 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC9Q96Q05 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC9Q96Q05 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC9Q96Q05 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC9Q96Q05 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC9Q96Q05 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC9Q96Q05 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC9Q96Q05 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC9Q96Q05 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC9Q96Q05 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC9Q96Q05 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC9Q96Q05 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC9Q96Q05 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC9Q96Q05 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC9Q96Q05 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC9Q96Q05 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC9Q96Q05 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC9Q96Q05 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms