Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUNDC3BQ96NL0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUNDC3BQ96NL0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUNDC3BQ96NL0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUNDC3BQ96NL0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUNDC3BQ96NL0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RUNDC3BQ96NL0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RUNDC3BQ96NL0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RUNDC3BQ96NL0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RUNDC3BQ96NL0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RUNDC3BQ96NL0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RUNDC3BQ96NL0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RUNDC3BQ96NL0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RUNDC3BQ96NL0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RUNDC3BQ96NL0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RUNDC3BQ96NL0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RUNDC3BQ96NL0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUNDC3BQ96NL0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUNDC3BQ96NL0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUNDC3BQ96NL0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUNDC3BQ96NL0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUNDC3BQ96NL0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUNDC3BQ96NL0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUNDC3BQ96NL0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUNDC3BQ96NL0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUNDC3BQ96NL0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RUNDC3BQ96NL0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RUNDC3BQ96NL0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RUNDC3BQ96NL0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RUNDC3BQ96NL0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RUNDC3BQ96NL0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RUNDC3BQ96NL0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RUNDC3BQ96NL0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RUNDC3BQ96NL0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RUNDC3BQ96NL0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RUNDC3BQ96NL0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RUNDC3BQ96NL0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RUNDC3BQ96NL0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RUNDC3BQ96NL0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUNDC3BQ96NL0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUNDC3BQ96NL0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUNDC3BQ96NL0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUNDC3BQ96NL0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUNDC3BQ96NL0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUNDC3BQ96NL0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUNDC3BQ96NL0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RUNDC3BQ96NL0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RUNDC3BQ96NL0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RUNDC3BQ96NL0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RUNDC3BQ96NL0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RUNDC3BQ96NL0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RUNDC3BQ96NL0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RUNDC3BQ96NL0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RUNDC3BQ96NL0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RUNDC3BQ96NL0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUNDC3BQ96NL0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUNDC3BQ96NL0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUNDC3BQ96NL0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUNDC3BQ96NL0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUNDC3BQ96NL0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUNDC3BQ96NL0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUNDC3BQ96NL0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUNDC3BQ96NL0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUNDC3BQ96NL0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUNDC3BQ96NL0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUNDC3BQ96NL0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUNDC3BQ96NL0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUNDC3BQ96NL0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUNDC3BQ96NL0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUNDC3BQ96NL0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUNDC3BQ96NL0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUNDC3BQ96NL0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUNDC3BQ96NL0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUNDC3BQ96NL0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUNDC3BQ96NL0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RUNDC3BQ96NL0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUNDC3BQ96NL0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUNDC3BQ96NL0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUNDC3BQ96NL0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RUNDC3BQ96NL0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RUNDC3BQ96NL0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUNDC3BQ96NL0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUNDC3BQ96NL0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RUNDC3BQ96NL0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUNDC3BQ96NL0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUNDC3BQ96NL0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUNDC3BQ96NL0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUNDC3BQ96NL0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUNDC3BQ96NL0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUNDC3BQ96NL0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUNDC3BQ96NL0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUNDC3BQ96NL0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUNDC3BQ96NL0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUNDC3BQ96NL0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUNDC3BQ96NL0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUNDC3BQ96NL0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUNDC3BQ96NL0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUNDC3BQ96NL0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RUNDC3BQ96NL0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUNDC3BQ96NL0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms