Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CMTM3Q96MX0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CMTM3Q96MX0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CMTM3Q96MX0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CMTM3Q96MX0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CMTM3Q96MX0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CMTM3Q96MX0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CMTM3Q96MX0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CMTM3Q96MX0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CMTM3Q96MX0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CMTM3Q96MX0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CMTM3Q96MX0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CMTM3Q96MX0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CMTM3Q96MX0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CMTM3Q96MX0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CMTM3Q96MX0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CMTM3Q96MX0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CMTM3Q96MX0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CMTM3Q96MX0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CMTM3Q96MX0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CMTM3Q96MX0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CMTM3Q96MX0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CMTM3Q96MX0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CMTM3Q96MX0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CMTM3Q96MX0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CMTM3Q96MX0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CMTM3Q96MX0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CMTM3Q96MX0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CMTM3Q96MX0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMTM3Q96MX0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMTM3Q96MX0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CMTM3Q96MX0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMTM3Q96MX0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMTM3Q96MX0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMTM3Q96MX0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMTM3Q96MX0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMTM3Q96MX0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMTM3Q96MX0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMTM3Q96MX0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMTM3Q96MX0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMTM3Q96MX0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMTM3Q96MX0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CMTM3Q96MX0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CMTM3Q96MX0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CMTM3Q96MX0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CMTM3Q96MX0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CMTM3Q96MX0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CMTM3Q96MX0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CMTM3Q96MX0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CMTM3Q96MX0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CMTM3Q96MX0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CMTM3Q96MX0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CMTM3Q96MX0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CMTM3Q96MX0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CMTM3Q96MX0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CMTM3Q96MX0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CMTM3Q96MX0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CMTM3Q96MX0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CMTM3Q96MX0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CMTM3Q96MX0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CMTM3Q96MX0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CMTM3Q96MX0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CMTM3Q96MX0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CMTM3Q96MX0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CMTM3Q96MX0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CMTM3Q96MX0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CMTM3Q96MX0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CMTM3Q96MX0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CMTM3Q96MX0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CMTM3Q96MX0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CMTM3Q96MX0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CMTM3Q96MX0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CMTM3Q96MX0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CMTM3Q96MX0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CMTM3Q96MX0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CMTM3Q96MX0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CMTM3Q96MX0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CMTM3Q96MX0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CMTM3Q96MX0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CMTM3Q96MX0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CMTM3Q96MX0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CMTM3Q96MX0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CMTM3Q96MX0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CMTM3Q96MX0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CMTM3Q96MX0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CMTM3Q96MX0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CMTM3Q96MX0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CMTM3Q96MX0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CMTM3Q96MX0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CMTM3Q96MX0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CMTM3Q96MX0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CMTM3Q96MX0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CMTM3Q96MX0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CMTM3Q96MX0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CMTM3Q96MX0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CMTM3Q96MX0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CMTM3Q96MX0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CMTM3Q96MX0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CMTM3Q96MX0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CMTM3Q96MX0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms