Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL15Q96M94 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL15Q96M94 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL15Q96M94 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL15Q96M94 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL15Q96M94 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL15Q96M94 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL15Q96M94 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL15Q96M94 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL15Q96M94 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL15Q96M94 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL15Q96M94 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL15Q96M94 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL15Q96M94 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL15Q96M94 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL15Q96M94 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL15Q96M94 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL15Q96M94 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL15Q96M94 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL15Q96M94 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL15Q96M94 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL15Q96M94 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL15Q96M94 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL15Q96M94 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL15Q96M94 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL15Q96M94 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL15Q96M94 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL15Q96M94 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL15Q96M94 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL15Q96M94 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL15Q96M94 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL15Q96M94 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL15Q96M94 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL15Q96M94 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL15Q96M94 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL15Q96M94 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL15Q96M94 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL15Q96M94 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL15Q96M94 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL15Q96M94 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL15Q96M94 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL15Q96M94 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL15Q96M94 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL15Q96M94 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL15Q96M94 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL15Q96M94 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL15Q96M94 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL15Q96M94 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL15Q96M94 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL15Q96M94 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL15Q96M94 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL15Q96M94 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL15Q96M94 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL15Q96M94 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL15Q96M94 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL15Q96M94 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL15Q96M94 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL15Q96M94 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL15Q96M94 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL15Q96M94 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL15Q96M94 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL15Q96M94 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL15Q96M94 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL15Q96M94 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL15Q96M94 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL15Q96M94 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL15Q96M94 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL15Q96M94 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL15Q96M94 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL15Q96M94 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL15Q96M94 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL15Q96M94 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL15Q96M94 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL15Q96M94 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL15Q96M94 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL15Q96M94 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL15Q96M94 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL15Q96M94 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL15Q96M94 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL15Q96M94 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL15Q96M94 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL15Q96M94 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL15Q96M94 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL15Q96M94 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL15Q96M94 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL15Q96M94 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL15Q96M94 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLHL15Q96M94 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLHL15Q96M94 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL15Q96M94 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL15Q96M94 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL15Q96M94 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL15Q96M94 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL15Q96M94 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL15Q96M94 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL15Q96M94 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL15Q96M94 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL15Q96M94 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL15Q96M94 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL15Q96M94 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms