Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC138Q96M89 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC138Q96M89 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC138Q96M89 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC138Q96M89 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC138Q96M89 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC138Q96M89 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC138Q96M89 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC138Q96M89 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC138Q96M89 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC138Q96M89 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC138Q96M89 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC138Q96M89 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC138Q96M89 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC138Q96M89 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC138Q96M89 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC138Q96M89 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC138Q96M89 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC138Q96M89 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC138Q96M89 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC138Q96M89 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC138Q96M89 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC138Q96M89 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC138Q96M89 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC138Q96M89 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC138Q96M89 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC138Q96M89 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC138Q96M89 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC138Q96M89 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC138Q96M89 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC138Q96M89 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC138Q96M89 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC138Q96M89 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC138Q96M89 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC138Q96M89 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC138Q96M89 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC138Q96M89 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC138Q96M89 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC138Q96M89 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC138Q96M89 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC138Q96M89 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC138Q96M89 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC138Q96M89 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC138Q96M89 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC138Q96M89 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC138Q96M89 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC138Q96M89 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC138Q96M89 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC138Q96M89 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC138Q96M89 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC138Q96M89 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC138Q96M89 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC138Q96M89 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC138Q96M89 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC138Q96M89 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC138Q96M89 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC138Q96M89 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC138Q96M89 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC138Q96M89 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC138Q96M89 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC138Q96M89 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC138Q96M89 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC138Q96M89 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC138Q96M89 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC138Q96M89 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC138Q96M89 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC138Q96M89 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC138Q96M89 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC138Q96M89 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC138Q96M89 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC138Q96M89 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC138Q96M89 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC138Q96M89 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC138Q96M89 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC138Q96M89 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC138Q96M89 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC138Q96M89 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC138Q96M89 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC138Q96M89 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC138Q96M89 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC138Q96M89 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC138Q96M89 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC138Q96M89 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC138Q96M89 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC138Q96M89 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC138Q96M89 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC138Q96M89 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC138Q96M89 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC138Q96M89 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC138Q96M89 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC138Q96M89 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC138Q96M89 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC138Q96M89 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC138Q96M89 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC138Q96M89 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC138Q96M89 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC138Q96M89 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC138Q96M89 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC138Q96M89 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC138Q96M89 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms