Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CCDC7Q96M83 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
CCDC7Q96M83 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CCDC7Q96M83 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
CCDC7Q96M83 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
CCDC7Q96M83 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC34.76■■■■□ 3.15
CCDC7Q96M83 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CCDC7Q96M83 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CCDC7Q96M83 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
CCDC7Q96M83 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CCDC7Q96M83 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CCDC7Q96M83 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CCDC7Q96M83 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CCDC7Q96M83 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
CCDC7Q96M83 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CCDC7Q96M83 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CCDC7Q96M83 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CCDC7Q96M83 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CCDC7Q96M83 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CCDC7Q96M83 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CCDC7Q96M83 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CCDC7Q96M83 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CCDC7Q96M83 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CCDC7Q96M83 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CCDC7Q96M83 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CCDC7Q96M83 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CCDC7Q96M83 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CCDC7Q96M83 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CCDC7Q96M83 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CCDC7Q96M83 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CCDC7Q96M83 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CCDC7Q96M83 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CCDC7Q96M83 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CCDC7Q96M83 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CCDC7Q96M83 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CCDC7Q96M83 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CCDC7Q96M83 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CCDC7Q96M83 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CCDC7Q96M83 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
CCDC7Q96M83 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CCDC7Q96M83 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CCDC7Q96M83 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CCDC7Q96M83 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CCDC7Q96M83 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CCDC7Q96M83 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CCDC7Q96M83 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
CCDC7Q96M83 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CCDC7Q96M83 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CCDC7Q96M83 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CCDC7Q96M83 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CCDC7Q96M83 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CCDC7Q96M83 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CCDC7Q96M83 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CCDC7Q96M83 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CCDC7Q96M83 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CCDC7Q96M83 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CCDC7Q96M83 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
CCDC7Q96M83 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CCDC7Q96M83 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CCDC7Q96M83 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CCDC7Q96M83 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CCDC7Q96M83 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CCDC7Q96M83 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CCDC7Q96M83 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CCDC7Q96M83 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CCDC7Q96M83 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CCDC7Q96M83 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CCDC7Q96M83 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CCDC7Q96M83 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CCDC7Q96M83 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CCDC7Q96M83 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CCDC7Q96M83 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
CCDC7Q96M83 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
CCDC7Q96M83 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CCDC7Q96M83 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CCDC7Q96M83 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CCDC7Q96M83 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CCDC7Q96M83 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CCDC7Q96M83 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CCDC7Q96M83 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CCDC7Q96M83 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CCDC7Q96M83 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CCDC7Q96M83 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CCDC7Q96M83 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CCDC7Q96M83 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CCDC7Q96M83 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
CCDC7Q96M83 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CCDC7Q96M83 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CCDC7Q96M83 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CCDC7Q96M83 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CCDC7Q96M83 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CCDC7Q96M83 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CCDC7Q96M83 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CCDC7Q96M83 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CCDC7Q96M83 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CCDC7Q96M83 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CCDC7Q96M83 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
CCDC7Q96M83 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CCDC7Q96M83 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
CCDC7Q96M83 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms