Protein–RNA interactions for Protein: Q96KD3

FAM71F1, Protein FAM71F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71F1Q96KD3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM71F1Q96KD3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM71F1Q96KD3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM71F1Q96KD3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM71F1Q96KD3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM71F1Q96KD3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM71F1Q96KD3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM71F1Q96KD3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM71F1Q96KD3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM71F1Q96KD3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM71F1Q96KD3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM71F1Q96KD3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM71F1Q96KD3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM71F1Q96KD3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM71F1Q96KD3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM71F1Q96KD3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM71F1Q96KD3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM71F1Q96KD3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM71F1Q96KD3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM71F1Q96KD3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM71F1Q96KD3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM71F1Q96KD3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM71F1Q96KD3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM71F1Q96KD3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM71F1Q96KD3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM71F1Q96KD3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM71F1Q96KD3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM71F1Q96KD3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM71F1Q96KD3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM71F1Q96KD3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM71F1Q96KD3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM71F1Q96KD3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM71F1Q96KD3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM71F1Q96KD3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM71F1Q96KD3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM71F1Q96KD3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM71F1Q96KD3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM71F1Q96KD3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM71F1Q96KD3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM71F1Q96KD3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM71F1Q96KD3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM71F1Q96KD3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM71F1Q96KD3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM71F1Q96KD3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM71F1Q96KD3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM71F1Q96KD3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM71F1Q96KD3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM71F1Q96KD3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM71F1Q96KD3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM71F1Q96KD3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM71F1Q96KD3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM71F1Q96KD3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM71F1Q96KD3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM71F1Q96KD3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM71F1Q96KD3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM71F1Q96KD3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM71F1Q96KD3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM71F1Q96KD3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM71F1Q96KD3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM71F1Q96KD3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM71F1Q96KD3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM71F1Q96KD3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM71F1Q96KD3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM71F1Q96KD3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM71F1Q96KD3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM71F1Q96KD3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM71F1Q96KD3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM71F1Q96KD3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM71F1Q96KD3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM71F1Q96KD3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM71F1Q96KD3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM71F1Q96KD3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM71F1Q96KD3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM71F1Q96KD3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM71F1Q96KD3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM71F1Q96KD3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM71F1Q96KD3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM71F1Q96KD3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM71F1Q96KD3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM71F1Q96KD3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM71F1Q96KD3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM71F1Q96KD3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM71F1Q96KD3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM71F1Q96KD3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM71F1Q96KD3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM71F1Q96KD3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM71F1Q96KD3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM71F1Q96KD3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM71F1Q96KD3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM71F1Q96KD3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM71F1Q96KD3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM71F1Q96KD3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM71F1Q96KD3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM71F1Q96KD3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM71F1Q96KD3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM71F1Q96KD3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM71F1Q96KD3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FAM71F1Q96KD3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FAM71F1Q96KD3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM71F1Q96KD3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms